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Chromosome 2, position 47480759, gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic variant? If pathogenic, what are the linked illness(es)?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_1']
ACTCATTCTAAAGCATTCACAGAAAGAATTATCTGTACTCTTTTTGGGACAGAATCTCGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCC
ACTCATTCTAAAGCATTCACAGAAAGAATTATCTGTACTCTTTTTGGGACAGAATCTCGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTC
pathogenic
35,055
Variant chromosome 2, position 47480759, gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic? Disease(s)?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
ACTCATTCTAAAGCATTCACAGAAAGAATTATCTGTACTCTTTTTGGGACAGAATCTCGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCC
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pathogenic
35,056
Variant at chromosome position 47480759, chromosome 2, gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic? If pathogenic, what condition(s) does it relate to?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome', 'Lynch_syndrome_1']
ACTCATTCTAAAGCATTCACAGAAAGAATTATCTGTACTCTTTTTGGGACAGAATCTCGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCC
ACTCATTCTAAAGCATTCACAGAAAGAATTATCTGTACTCTTTTTGGGACAGAATCTCGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCNN
pathogenic
35,057
For chromosome 2, position 47480762, gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic mutation? If pathogenic, what are the associated disease(s)?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome', 'Lynch_syndrome_1']
CATTCTAAAGCATTCACAGAAAGAATTATCTGTACTCTTTTTGGGACAGAATCTCGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGT
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pathogenic
35,058
A genetic variant at chromosome 2, position 47480773, affecting gene MSH2 (mutS homolog 2)—is it benign or pathogenic? If pathogenic, identify the associated disorder(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome']
ATTCACAGAAAGAATTATCTGTACTCTTTTTGGGACAGAATCTCGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAA
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pathogenic
35,062
Chromosome 2, position 47480779, gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic variant? If pathogenic, what are the linked illness(es)?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome']
AGAAAGAATTATCTGTACTCTTTTTGGGACAGAATCTCGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATG
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pathogenic
35,064
Clinical classification of chromosome 2, position 47480788, gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic? Disease(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_1']
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TATCTGTACTCTTTTTGGGACAGAATCTCGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACCATTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTA
pathogenic
35,070
Is the genetic mutation found on chromosome 2 at position 47480796, within the gene MSH2 (mutS homolog 2), considered benign or pathogenic? If pathogenic, specify the associated disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_1']
CTCTTTTTGGGACAGAATCTCGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTC
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pathogenic
35,075
The chromosome 2, position 47480812 genetic variant in gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic? If pathogenic, indicate disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
ATCTCGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACA
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pathogenic
35,083
Mutation found at chromosome 2 position 47480820, gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic? If pathogenic, indicate the relevant disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
CTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTT
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pathogenic
35,088
Is the genetic variant on chromosome 2, position 47480824, gene MSH2 (mutS homolog 2), benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) is indicated?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_1']
TGCCCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAA
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pathogenic
35,092
Does the variant impacting MSH2 (mutS homolog 2) on chromosome 2, position 47480827, classify as benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) is it associated with?
pathogenic; ['Lynch_syndrome']
CCAGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAG
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pathogenic
35,094
Does the genetic variant at chromosome 2, position 47480829, impacting gene MSH2 (mutS homolog 2), appear benign or pathogenic? If pathogenic, name the associated disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
AGGCTGGAGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCT
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pathogenic
35,095
Gene MSH2 (mutS homolog 2) variant at chromosome 2, position 47480865—is it benign or pathogenic? If pathogenic, what are the associated condition(s)?
pathogenic; ['Gastric_cancer', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome', 'Lynch_syndrome_1', 'likely other unspecified diseases']
CCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGT
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pathogenic
35,109
Is the genetic change at chromosome 2, position 47480878, within gene MSH2 (mutS homolog 2) benign or pathogenic? Name the disease(s) if pathogenic.
benign
AGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATT
AGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTN
benign
35,119
Clinical impact (benign or pathogenic) of the variant at chromosome 2, location 47480879, gene MSH2 (mutS homolog 2): what disease(s) if pathogenic?
benign
GCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTT
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benign
35,122
The mutation impacting MSH2 (mutS homolog 2) on chromosome 2 at position 47480879: benign or pathogenic? Name the associated disease(s) if pathogenic.
benign
GCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTT
GCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGCAATCCACCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGAATTATCTGTACTCTTGAACATCACCATGGAGGCATTTTCTGCTACCTCCCATGGCAGTATGTTTTCTTGTTGAATTAGGATAACAAACAATATGCTTTCAAGTTCCAAAGTTCTAGCTGTTATTGTTTAACAAAATCTTCATTATAATTAGCTTATTTTGTGTTTAAGAGTGTGTTATAGAAACAGGTTCATTTAAAGCTGGGGGTTCCAGAAATCTTGAAATAGTAGTTATCACATGCAGAGTGACTTATCTGTTGTTGTTTCATCCTTTCAGGAAAGTTTGTCATTCGTGGGCTTGGGATCTAGTCAGATCCCTGTATTGATGAGATTCACATGTTATAAGGCTTTCAAAGGTTTTAAAAATCATACTATAAGGATTGATTTCACTAGTCACCAGAATAACTTTTTCAGATAGCGCTCTGATTTTCCACGAACACGTTTTTCTGCATCAGTTGGTTGCACATGAGTGAGATAATCTTGGTTCTTTATCCTTTGTTATTTGTACTTCATTGGGAATCCTTTTGAGTTAGTATATTTGAGTCATTATTATTATTGCTGTAGAATTCAGGAACTTTTAGTAGATCTGGCAGCATAAAATTTTGCTTTTAAATCATTGTTTGTGTTTTGTATGCTATAGAAATGGGTTCAGAATATTTTTTAAAAGGCCAGATGAAGTGTGAAGATAGAAAAACTTCATCCTTCACTGTGAATGTTTAACAAACATTTGCTTCTACTTTATTTTTGTTTGCTTCCTTTAGTTGTGCAAAGTATTCAGTTCTAGAATGCATGAGATATATGACAAAGCCAAAAAATTCTTTATAGTTGATAAATAATTGTGGCAAAAACAGCTGTATAGTAACTTTGCAAGCATCATTTGATTAAATGCTTAAAAAGTCTTGACTCAGTTTTAACTATTTCCTGCAAATAATCAATATTTAATTAAAGCTACTCCAAATTAGTGACACTTTACGTGTCTGTCTTTCTCCCTCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCATTCTCCCATTCTCCCTTCTCTCTTCTTCCTTTCCTCTTCCCTTCCCTTCCCCTTTCCCTTCCCCCTTCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCCATCCCTTCCCTTCCCCCATCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTCCTCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTTCCTCTTCCCTTTCCCCTTCCCTTCCCCCTTCCCTTCCCTCTTCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCCTCCCCCTCTCCTCCCCTCCCTTACCTTCCCATGAAATGAGAAAGCCTCAGAGATAGTGGCTTGATTAATTTTTCTTTAGATTAAGATATTTGTCTAAGCCTTTAAGGTTTATCTATTGAGCTTTTTTGTCTCCTATTTTTATTTTTCCTACTATGTTTGTCGAGGATAAAATACAGCACTGTGTGCCAAGTCATAATCACTTTTCATTTGAGACTTAATTAAAATGCCTTTATTTTAATGATATATTTGGCTAATGTATTTGAAGTAATCCGAAATTAAGTTTTCTAATGACAAGGTGAGAAGGATAAATTCCATTTACATAAATTGCTGTCTCTTCTCATGCTGTCCCCTCACGCTTCCCCAAATTTCTTATAGGTGTCTGTGATCAAAGTTTTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCATTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTTNN
benign
35,123
Clinical significance of chromosome 2, position 47482762, gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic? Name the disease(s) if pathogenic.
benign
TTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTTCACGAATAAAAGTTACTACGTGAAAAATCCCAGTAATGGAATGAAGGTAATATTGATAAGCTATTGTCTGTAATAGTTTTATATTGTTTTATATTAACCCTTTTTCCATAGTGTTAACTGTCAGTGCCCATGGGCTATCAACTTAATAAGATATTTAGTAATATTTTACTTTGAGGACATTTTCAAAGATTTTTATTTTGAAAAATGAGAGCTGTAACTGAGGACTGTTTGCAATTGACATAGGCAATAATAAGTGATGTGCTGAATTTTATAAATAAAATCATGTAGTTTGTGGAATTTGAGATGCATTGTAGTTCTTCGCAGTGTGACTTCAAATATTTTGGAAGAAACAAATAGCTCAGAGACCTCGTAAAATATCTTAAACTGGAGGGCTCCATGGAGATCATTGCGAGTGACTCCCCCAGAATGTCCATCTGTTGACAGGAGCCAGGCTGGCTGCATACGAATTAGCTAAGGAGCTTATTATATATCCAGAGTCCTACCGTGAGCCTCCATCCCGTCTGCCATTCTCCCATCCCTGGTCTATGATAAGACTTAGAAATCTGGATTTTAACAAAACGTTTCAGATTGAGAACCTTGATTTAGTCTACTTCTCCTATTTTACAATAAAGAGATGAAGCGGTTAAGAATTAGCTAATCCTACGCAAAGTGAGGGAAAAAGGACAGTCTTTTTAATAAATGCGGCGGGCTGGTGGGGTATCCATATAGGAAGAAATGACATTGGACCCCTACTCCATGTCATATATAAAAACCTCCACTTTGGGAGGCGAAGCAGGCAATCACTTGAACTCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGACAACATGACGAAACCCCATCTCTACAAAAATAAATGCAAAAATTAGCCGGGCATAGTGGTGCTTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACGTGATCTGGGAGAGGTTGAGGTTACAGTGAGCTGCACTCCATCCTGGGTAATACAGTGATAACTGTGTCTCAAACAAAACAAAACAAATCACCTTCAGTGATTTTTAGACCAAATGTACAAGGTAATACTCTCAAGGTTTTAATGTTTTATAGTTCTGCAGAAGATAACATAGGAAAATATTTTTATGTCCTTGGCTTTGGGAAGAATTTAAGTCACAGAAAAACACCATCCATAAAGTTTGACTTATTTAGCTATTTGAAATTAACAACTTCTATTAAAAGGCACCACAAGTGAAAAGACATGAATCGTAATGGAAGAACATACTGGTACGTTATAAAATATCAAAGAGTTGGGCATGGTGTCCCATGCTTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGCAGTTCAAGTCTCAGCAGTTCAAGTCCAGCCTGGGCAATATAGCAAGACTGCATTTCTTTTCTTCTTCTTTTTTAATACCTGGAATAAAGAACTCCTATAAAATCACTAAGAAAAGGGGTCACTTAAGAATCTCATTAACAAAAAGAATTTGAATATTTTTCCAAGGAAGATATGCAAATGGACTGTAAGCACATGAAAAGATGCAGATCAGGGAAATGCAAGTCAAAACCACAATGAGCTACAACTTCACACTGATTACGATAGTTAAAATCAAAAAGTCAGATGGTAAGTACTGGCAAGGAAGTGGAGAAATTGAAACTGTCATGCGCTCTTGGTGCGAATGTAAAATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAGACAATTCCACTCCAACGTATATCCAAGTGGAATCACAACATATGTCCCCACAAACTTGTACATAAATGTTTATAGCAGGATTATTCATAATAGCCAAAAGGTGGAAACAACCCGAATGTCCATCAGCAGA
TTGGGATTCATGTTGCAGAGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTTCACGAATAAAAGTTACTACGTGAAAAATCCCAGTAATGGAATGAAGGTAATATTGATAAGCTATTGTCTGTAATAGTTTTATATTGTTTTATATTAACCCTTTTTCCATAGTGTTAACTGTCAGTGCCCATGGGCTATCAACTTAATAAGATATTTAGTAATATTTTACTTTGAGGACATTTTCAAAGATTTTTATTTTGAAAAATGAGAGCTGTAACTGAGGACTGTTTGCAATTGACATAGGCAATAATAAGTGATGTGCTGAATTTTATAAATAAAATCATGTAGTTTGTGGAATTTGAGATGCATTGTAGTTCTTCGCAGTGTGACTTCAAATATTTTGGAAGAAACAAATAGCTCAGAGACCTCGTAAAATATCTTAAACTGGAGGGCTCCATGGAGATCATTGCGAGTGACTCCCCCAGAATGTCCATCTGTTGACAGGAGCCAGGCTGGCTGCATACGAATTAGCTAAGGAGCTTATTATATATCCAGAGTCCTACCGTGAGCCTCCATCCCGTCTGCCATTCTCCCATCCCTGGTCTATGATAAGACTTAGAAATCTGGATTTTAACAAAACGTTTCAGATTGAGAACCTTGATTTAGTCTACTTCTCCTATTTTACAATAAAGAGATGAAGCGGTTAAGAATTAGCTAATCCTACGCAAAGTGAGGGAAAAAGGACAGTCTTTTTAATAAATGCGGCGGGCTGGTGGGGTATCCATATAGGAAGAAATGACATTGGACCCCTACTCCATGTCATATATAAAAACCTCCACTTTGGGAGGCGAAGCAGGCAATCACTTGAACTCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGACAACATGACGAAACCCCATCTCTACAAAAATAAATGCAAAAATTAGCCGGGCATAGTGGTGCTTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACGTGATCTGGGAGAGGTTGAGGTTACAGTGAGCTGCACTCCATCCTGGGTAATACAGTGATAACTGTGTCTCAAACAAAACAAAACAAATCACCTTCAGTGATTTTTAGACCAAATGTACAAGGTAATACTCTCAAGGTTTTAATGTTTTATAGTTCTGCAGAAGATAACATAGGAAAATATTTTTATGTCCTTGGCTTTGGGAAGAATTTAAGTCACAGAAAAACACCATCCATAAAGTTTGACTTATTTAGCTATTTGAAATTAACAACTTCTATTAAAAGGCACCACAAGTGAAAAGACATGAATCGTAATGGAAGAACATACTGGTACGTTATAAAATATCAAAGAGTTGGGCATGGTGTCCCATGCTTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGCAGTTCAAGTCTCAGCAGTTCAAGTCCAGCCTGGGCAATATAGCAAGACTGCATTTCTTTTCTTCTTCTTTTTTAATACCTGGAATAAAGAACTCCTATAAAATCACTAAGAAAAGGGGTCACTTAAGAATCTCATTAACAAAAAGAATTTGAATATTTTTCCAAGGAAGATATGCAAATGGACTGTAAGCACATGAAAAGATGCAGATCAGGGAAATGCAAGTCAAAACCACAATGAGCTACAACTTCACACTGATTACGATAGTTAAAATCAAAAAGTCAGATGGTAAGTACTGGCAAGGAAGTGGAGAAATTGAAACTGTCATGCGCTCTTGGTGCGAATGTAAAATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAGACAATTCCACTCCAACGTATATCCAAGTGGAATCACAACATATGTCCCCACAAACTTGTACATAAATGTTTATAGCAGGATTATTCATAATAGCCAAAAGGTGGAAACAACCCGAATGTCCATCAGCAGAN
benign
35,133
For chromosome 2, position 47482780, gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic mutation? If pathogenic, what are the associated disease(s)?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
AGCTTGCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTTCACGAATAAAAGTTACTACGTGAAAAATCCCAGTAATGGAATGAAGGTAATATTGATAAGCTATTGTCTGTAATAGTTTTATATTGTTTTATATTAACCCTTTTTCCATAGTGTTAACTGTCAGTGCCCATGGGCTATCAACTTAATAAGATATTTAGTAATATTTTACTTTGAGGACATTTTCAAAGATTTTTATTTTGAAAAATGAGAGCTGTAACTGAGGACTGTTTGCAATTGACATAGGCAATAATAAGTGATGTGCTGAATTTTATAAATAAAATCATGTAGTTTGTGGAATTTGAGATGCATTGTAGTTCTTCGCAGTGTGACTTCAAATATTTTGGAAGAAACAAATAGCTCAGAGACCTCGTAAAATATCTTAAACTGGAGGGCTCCATGGAGATCATTGCGAGTGACTCCCCCAGAATGTCCATCTGTTGACAGGAGCCAGGCTGGCTGCATACGAATTAGCTAAGGAGCTTATTATATATCCAGAGTCCTACCGTGAGCCTCCATCCCGTCTGCCATTCTCCCATCCCTGGTCTATGATAAGACTTAGAAATCTGGATTTTAACAAAACGTTTCAGATTGAGAACCTTGATTTAGTCTACTTCTCCTATTTTACAATAAAGAGATGAAGCGGTTAAGAATTAGCTAATCCTACGCAAAGTGAGGGAAAAAGGACAGTCTTTTTAATAAATGCGGCGGGCTGGTGGGGTATCCATATAGGAAGAAATGACATTGGACCCCTACTCCATGTCATATATAAAAACCTCCACTTTGGGAGGCGAAGCAGGCAATCACTTGAACTCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGACAACATGACGAAACCCCATCTCTACAAAAATAAATGCAAAAATTAGCCGGGCATAGTGGTGCTTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACGTGATCTGGGAGAGGTTGAGGTTACAGTGAGCTGCACTCCATCCTGGGTAATACAGTGATAACTGTGTCTCAAACAAAACAAAACAAATCACCTTCAGTGATTTTTAGACCAAATGTACAAGGTAATACTCTCAAGGTTTTAATGTTTTATAGTTCTGCAGAAGATAACATAGGAAAATATTTTTATGTCCTTGGCTTTGGGAAGAATTTAAGTCACAGAAAAACACCATCCATAAAGTTTGACTTATTTAGCTATTTGAAATTAACAACTTCTATTAAAAGGCACCACAAGTGAAAAGACATGAATCGTAATGGAAGAACATACTGGTACGTTATAAAATATCAAAGAGTTGGGCATGGTGTCCCATGCTTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGCAGTTCAAGTCTCAGCAGTTCAAGTCCAGCCTGGGCAATATAGCAAGACTGCATTTCTTTTCTTCTTCTTTTTTAATACCTGGAATAAAGAACTCCTATAAAATCACTAAGAAAAGGGGTCACTTAAGAATCTCATTAACAAAAAGAATTTGAATATTTTTCCAAGGAAGATATGCAAATGGACTGTAAGCACATGAAAAGATGCAGATCAGGGAAATGCAAGTCAAAACCACAATGAGCTACAACTTCACACTGATTACGATAGTTAAAATCAAAAAGTCAGATGGTAAGTACTGGCAAGGAAGTGGAGAAATTGAAACTGTCATGCGCTCTTGGTGCGAATGTAAAATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAGACAATTCCACTCCAACGTATATCCAAGTGGAATCACAACATATGTCCCCACAAACTTGTACATAAATGTTTATAGCAGGATTATTCATAATAGCCAAAAGGTGGAAACAACCCGAATGTCCATCAGCAGATGAATGCATAAATGAAAC
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pathogenic
35,145
The genetic variant at chromosome 2, position 47482785, affecting gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic? Disease name(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Endometrial_carcinoma', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_1']
GCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTTCACGAATAAAAGTTACTACGTGAAAAATCCCAGTAATGGAATGAAGGTAATATTGATAAGCTATTGTCTGTAATAGTTTTATATTGTTTTATATTAACCCTTTTTCCATAGTGTTAACTGTCAGTGCCCATGGGCTATCAACTTAATAAGATATTTAGTAATATTTTACTTTGAGGACATTTTCAAAGATTTTTATTTTGAAAAATGAGAGCTGTAACTGAGGACTGTTTGCAATTGACATAGGCAATAATAAGTGATGTGCTGAATTTTATAAATAAAATCATGTAGTTTGTGGAATTTGAGATGCATTGTAGTTCTTCGCAGTGTGACTTCAAATATTTTGGAAGAAACAAATAGCTCAGAGACCTCGTAAAATATCTTAAACTGGAGGGCTCCATGGAGATCATTGCGAGTGACTCCCCCAGAATGTCCATCTGTTGACAGGAGCCAGGCTGGCTGCATACGAATTAGCTAAGGAGCTTATTATATATCCAGAGTCCTACCGTGAGCCTCCATCCCGTCTGCCATTCTCCCATCCCTGGTCTATGATAAGACTTAGAAATCTGGATTTTAACAAAACGTTTCAGATTGAGAACCTTGATTTAGTCTACTTCTCCTATTTTACAATAAAGAGATGAAGCGGTTAAGAATTAGCTAATCCTACGCAAAGTGAGGGAAAAAGGACAGTCTTTTTAATAAATGCGGCGGGCTGGTGGGGTATCCATATAGGAAGAAATGACATTGGACCCCTACTCCATGTCATATATAAAAACCTCCACTTTGGGAGGCGAAGCAGGCAATCACTTGAACTCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGACAACATGACGAAACCCCATCTCTACAAAAATAAATGCAAAAATTAGCCGGGCATAGTGGTGCTTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACGTGATCTGGGAGAGGTTGAGGTTACAGTGAGCTGCACTCCATCCTGGGTAATACAGTGATAACTGTGTCTCAAACAAAACAAAACAAATCACCTTCAGTGATTTTTAGACCAAATGTACAAGGTAATACTCTCAAGGTTTTAATGTTTTATAGTTCTGCAGAAGATAACATAGGAAAATATTTTTATGTCCTTGGCTTTGGGAAGAATTTAAGTCACAGAAAAACACCATCCATAAAGTTTGACTTATTTAGCTATTTGAAATTAACAACTTCTATTAAAAGGCACCACAAGTGAAAAGACATGAATCGTAATGGAAGAACATACTGGTACGTTATAAAATATCAAAGAGTTGGGCATGGTGTCCCATGCTTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGCAGTTCAAGTCTCAGCAGTTCAAGTCCAGCCTGGGCAATATAGCAAGACTGCATTTCTTTTCTTCTTCTTTTTTAATACCTGGAATAAAGAACTCCTATAAAATCACTAAGAAAAGGGGTCACTTAAGAATCTCATTAACAAAAAGAATTTGAATATTTTTCCAAGGAAGATATGCAAATGGACTGTAAGCACATGAAAAGATGCAGATCAGGGAAATGCAAGTCAAAACCACAATGAGCTACAACTTCACACTGATTACGATAGTTAAAATCAAAAAGTCAGATGGTAAGTACTGGCAAGGAAGTGGAGAAATTGAAACTGTCATGCGCTCTTGGTGCGAATGTAAAATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAGACAATTCCACTCCAACGTATATCCAAGTGGAATCACAACATATGTCCCCACAAACTTGTACATAAATGTTTATAGCAGGATTATTCATAATAGCCAAAAGGTGGAAACAACCCGAATGTCCATCAGCAGATGAATGCATAAATGAAACGTGGT
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pathogenic
35,146
For chromosome 2, position 47482785, gene MSH2 (mutS homolog 2): benign or pathogenic mutation? If pathogenic, what are the associated disease(s)?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_1']
GCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTTCACGAATAAAAGTTACTACGTGAAAAATCCCAGTAATGGAATGAAGGTAATATTGATAAGCTATTGTCTGTAATAGTTTTATATTGTTTTATATTAACCCTTTTTCCATAGTGTTAACTGTCAGTGCCCATGGGCTATCAACTTAATAAGATATTTAGTAATATTTTACTTTGAGGACATTTTCAAAGATTTTTATTTTGAAAAATGAGAGCTGTAACTGAGGACTGTTTGCAATTGACATAGGCAATAATAAGTGATGTGCTGAATTTTATAAATAAAATCATGTAGTTTGTGGAATTTGAGATGCATTGTAGTTCTTCGCAGTGTGACTTCAAATATTTTGGAAGAAACAAATAGCTCAGAGACCTCGTAAAATATCTTAAACTGGAGGGCTCCATGGAGATCATTGCGAGTGACTCCCCCAGAATGTCCATCTGTTGACAGGAGCCAGGCTGGCTGCATACGAATTAGCTAAGGAGCTTATTATATATCCAGAGTCCTACCGTGAGCCTCCATCCCGTCTGCCATTCTCCCATCCCTGGTCTATGATAAGACTTAGAAATCTGGATTTTAACAAAACGTTTCAGATTGAGAACCTTGATTTAGTCTACTTCTCCTATTTTACAATAAAGAGATGAAGCGGTTAAGAATTAGCTAATCCTACGCAAAGTGAGGGAAAAAGGACAGTCTTTTTAATAAATGCGGCGGGCTGGTGGGGTATCCATATAGGAAGAAATGACATTGGACCCCTACTCCATGTCATATATAAAAACCTCCACTTTGGGAGGCGAAGCAGGCAATCACTTGAACTCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGACAACATGACGAAACCCCATCTCTACAAAAATAAATGCAAAAATTAGCCGGGCATAGTGGTGCTTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACGTGATCTGGGAGAGGTTGAGGTTACAGTGAGCTGCACTCCATCCTGGGTAATACAGTGATAACTGTGTCTCAAACAAAACAAAACAAATCACCTTCAGTGATTTTTAGACCAAATGTACAAGGTAATACTCTCAAGGTTTTAATGTTTTATAGTTCTGCAGAAGATAACATAGGAAAATATTTTTATGTCCTTGGCTTTGGGAAGAATTTAAGTCACAGAAAAACACCATCCATAAAGTTTGACTTATTTAGCTATTTGAAATTAACAACTTCTATTAAAAGGCACCACAAGTGAAAAGACATGAATCGTAATGGAAGAACATACTGGTACGTTATAAAATATCAAAGAGTTGGGCATGGTGTCCCATGCTTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGCAGTTCAAGTCTCAGCAGTTCAAGTCCAGCCTGGGCAATATAGCAAGACTGCATTTCTTTTCTTCTTCTTTTTTAATACCTGGAATAAAGAACTCCTATAAAATCACTAAGAAAAGGGGTCACTTAAGAATCTCATTAACAAAAAGAATTTGAATATTTTTCCAAGGAAGATATGCAAATGGACTGTAAGCACATGAAAAGATGCAGATCAGGGAAATGCAAGTCAAAACCACAATGAGCTACAACTTCACACTGATTACGATAGTTAAAATCAAAAAGTCAGATGGTAAGTACTGGCAAGGAAGTGGAGAAATTGAAACTGTCATGCGCTCTTGGTGCGAATGTAAAATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAGACAATTCCACTCCAACGTATATCCAAGTGGAATCACAACATATGTCCCCACAAACTTGTACATAAATGTTTATAGCAGGATTATTCATAATAGCCAAAAGGTGGAAACAACCCGAATGTCCATCAGCAGATGAATGCATAAATGAAACGTGGT
GCTAATTTCCCTAAGCATGTAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTTCACGAATAAAAGTTACTACGTGAAAAATCCCAGTAATGGAATGAAGGTAATATTGATAAGCTATTGTCTGTAATAGTTTTATATTGTTTTATATTAACCCTTTTTCCATAGTGTTAACTGTCAGTGCCCATGGGCTATCAACTTAATAAGATATTTAGTAATATTTTACTTTGAGGACATTTTCAAAGATTTTTATTTTGAAAAATGAGAGCTGTAACTGAGGACTGTTTGCAATTGACATAGGCAATAATAAGTGATGTGCTGAATTTTATAAATAAAATCATGTAGTTTGTGGAATTTGAGATGCATTGTAGTTCTTCGCAGTGTGACTTCAAATATTTTGGAAGAAACAAATAGCTCAGAGACCTCGTAAAATATCTTAAACTGGAGGGCTCCATGGAGATCATTGCGAGTGACTCCCCCAGAATGTCCATCTGTTGACAGGAGCCAGGCTGGCTGCATACGAATTAGCTAAGGAGCTTATTATATATCCAGAGTCCTACCGTGAGCCTCCATCCCGTCTGCCATTCTCCCATCCCTGGTCTATGATAAGACTTAGAAATCTGGATTTTAACAAAACGTTTCAGATTGAGAACCTTGATTTAGTCTACTTCTCCTATTTTACAATAAAGAGATGAAGCGGTTAAGAATTAGCTAATCCTACGCAAAGTGAGGGAAAAAGGACAGTCTTTTTAATAAATGCGGCGGGCTGGTGGGGTATCCATATAGGAAGAAATGACATTGGACCCCTACTCCATGTCATATATAAAAACCTCCACTTTGGGAGGCGAAGCAGGCAATCACTTGAACTCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGACAACATGACGAAACCCCATCTCTACAAAAATAAATGCAAAAATTAGCCGGGCATAGTGGTGCTTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACGTGATCTGGGAGAGGTTGAGGTTACAGTGAGCTGCACTCCATCCTGGGTAATACAGTGATAACTGTGTCTCAAACAAAACAAAACAAATCACCTTCAGTGATTTTTAGACCAAATGTACAAGGTAATACTCTCAAGGTTTTAATGTTTTATAGTTCTGCAGAAGATAACATAGGAAAATATTTTTATGTCCTTGGCTTTGGGAAGAATTTAAGTCACAGAAAAACACCATCCATAAAGTTTGACTTATTTAGCTATTTGAAATTAACAACTTCTATTAAAAGGCACCACAAGTGAAAAGACATGAATCGTAATGGAAGAACATACTGGTACGTTATAAAATATCAAAGAGTTGGGCATGGTGTCCCATGCTTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGCAGTTCAAGTCTCAGCAGTTCAAGTCCAGCCTGGGCAATATAGCAAGACTGCATTTCTTTTCTTCTTCTTTTTTAATACCTGGAATAAAGAACTCCTATAAAATCACTAAGAAAAGGGGTCACTTAAGAATCTCATTAACAAAAAGAATTTGAATATTTTTCCAAGGAAGATATGCAAATGGACTGTAAGCACATGAAAAGATGCAGATCAGGGAAATGCAAGTCAAAACCACAATGAGCTACAACTTCACACTGATTACGATAGTTAAAATCAAAAAGTCAGATGGTAAGTACTGGCAAGGAAGTGGAGAAATTGAAACTGTCATGCGCTCTTGGTGCGAATGTAAAATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAGACAATTCCACTCCAACGTATATCCAAGTGGAATCACAACATATGTCCCCACAAACTTGTACATAAATGTTTATAGCAGGATTATTCATAATAGCCAAAAGGTGGAAACAACCCGAATGTCCATCAGCAGATGAATGCATAAATGAAACGTGGTN
pathogenic
35,148
Clinical impact (benign or pathogenic) of the variant at chromosome 2, location 47482804, gene MSH2 (mutS homolog 2): what disease(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Carcinoma_of_colon', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_1']
TAATAGAGTGTGCTAAACAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTTCACGAATAAAAGTTACTACGTGAAAAATCCCAGTAATGGAATGAAGGTAATATTGATAAGCTATTGTCTGTAATAGTTTTATATTGTTTTATATTAACCCTTTTTCCATAGTGTTAACTGTCAGTGCCCATGGGCTATCAACTTAATAAGATATTTAGTAATATTTTACTTTGAGGACATTTTCAAAGATTTTTATTTTGAAAAATGAGAGCTGTAACTGAGGACTGTTTGCAATTGACATAGGCAATAATAAGTGATGTGCTGAATTTTATAAATAAAATCATGTAGTTTGTGGAATTTGAGATGCATTGTAGTTCTTCGCAGTGTGACTTCAAATATTTTGGAAGAAACAAATAGCTCAGAGACCTCGTAAAATATCTTAAACTGGAGGGCTCCATGGAGATCATTGCGAGTGACTCCCCCAGAATGTCCATCTGTTGACAGGAGCCAGGCTGGCTGCATACGAATTAGCTAAGGAGCTTATTATATATCCAGAGTCCTACCGTGAGCCTCCATCCCGTCTGCCATTCTCCCATCCCTGGTCTATGATAAGACTTAGAAATCTGGATTTTAACAAAACGTTTCAGATTGAGAACCTTGATTTAGTCTACTTCTCCTATTTTACAATAAAGAGATGAAGCGGTTAAGAATTAGCTAATCCTACGCAAAGTGAGGGAAAAAGGACAGTCTTTTTAATAAATGCGGCGGGCTGGTGGGGTATCCATATAGGAAGAAATGACATTGGACCCCTACTCCATGTCATATATAAAAACCTCCACTTTGGGAGGCGAAGCAGGCAATCACTTGAACTCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGACAACATGACGAAACCCCATCTCTACAAAAATAAATGCAAAAATTAGCCGGGCATAGTGGTGCTTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACGTGATCTGGGAGAGGTTGAGGTTACAGTGAGCTGCACTCCATCCTGGGTAATACAGTGATAACTGTGTCTCAAACAAAACAAAACAAATCACCTTCAGTGATTTTTAGACCAAATGTACAAGGTAATACTCTCAAGGTTTTAATGTTTTATAGTTCTGCAGAAGATAACATAGGAAAATATTTTTATGTCCTTGGCTTTGGGAAGAATTTAAGTCACAGAAAAACACCATCCATAAAGTTTGACTTATTTAGCTATTTGAAATTAACAACTTCTATTAAAAGGCACCACAAGTGAAAAGACATGAATCGTAATGGAAGAACATACTGGTACGTTATAAAATATCAAAGAGTTGGGCATGGTGTCCCATGCTTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGCAGTTCAAGTCTCAGCAGTTCAAGTCCAGCCTGGGCAATATAGCAAGACTGCATTTCTTTTCTTCTTCTTTTTTAATACCTGGAATAAAGAACTCCTATAAAATCACTAAGAAAAGGGGTCACTTAAGAATCTCATTAACAAAAAGAATTTGAATATTTTTCCAAGGAAGATATGCAAATGGACTGTAAGCACATGAAAAGATGCAGATCAGGGAAATGCAAGTCAAAACCACAATGAGCTACAACTTCACACTGATTACGATAGTTAAAATCAAAAAGTCAGATGGTAAGTACTGGCAAGGAAGTGGAGAAATTGAAACTGTCATGCGCTCTTGGTGCGAATGTAAAATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAGACAATTCCACTCCAACGTATATCCAAGTGGAATCACAACATATGTCCCCACAAACTTGTACATAAATGTTTATAGCAGGATTATTCATAATAGCCAAAAGGTGGAAACAACCCGAATGTCCATCAGCAGATGAATGCATAAATGAAACGTGGTCTATCCATACAATGGAGTA
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pathogenic
35,152
Gene MSH2 (mutS homolog 2) variant at chromosome position 47482821 on chromosome 2: benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) is it associated with?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colon_cancer', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome', 'Lynch_syndrome_1', 'MSH2-related_disorder']
CAGAAAGCCCTGGAACTTGAGGAGTTTCAGTATATTGGAGAATCGCAAGGATATGATATCATGGAACCAGCAGCAAAGAAGTGCTATCTGGAAAGAGAGGTTTGTCAGTTTGTTTTCATAGTTTAACTTAGCTTCTCTATTATTACATAAACAGGACACTAAGATGAAGGTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCCTCTGTGTTTCTAGTGCTTATTTTTTAATCAGTTTTTTTGATGGCAAAGAATCTATCTCTGTGTTATTTTGATTTCTGCAGTATATACATCTGCATGATCAATATTCGATTTCAAGTACCAAAGTAGGAGTAAAGGAATATTAACCTAGGTTTAAAATTAGTCATTTCACTAAAATTAGTTATTATGGACGATAGATGTCTAGGTATATCTTTGTTCATAAACGAATATATCAAGTTCAGTTATTAAATTACACATTAGGTAAGAAAAGGACAAAGAAATAAAAAAGCATGATTCATAATTCCTGCCCTCTATTTGTCTAGAATTTAGTTGGGAAGATAAGAATAACGAACGTGACACAGAGAATAAAGTGGCATATGACAAATATTTATTCAAGAAAGCTATATGTGGACGGGATGTTTCAGTTCTCATGGGAGAAGTGGATTTTATGGTGCCTTTGAGTAATGGGTCATATTTGGGCGTTCACACAGAAAGACCCAAGCATATGCCTAATTTTTTATTATTATTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGAGCAGGGGCGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGAGTGGGCCACTGTGCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAGAGGATTACTAGTTCTCTTCAATTATAAAAATAAAAGAATCTTATTTCACTGCCTGGTCCTGGAAACATGTACTGCAATATACATTGTGACAACTTTTTACCTGTCATGTTTTTAGCTTTTACCTGTGAATGTCTTATCATTGTTCTTATCTGAAGGATAGATAGTTGCTACAATAATAATAGATGGTGTGTATGGTTTTTGAGCCTAAAAAGTGTAGTTTTATCTGTTGTACCTATACAAGCAGGAGAAATATAACTTGTTAATAATTTTAGGTATGGCAGGCTGCCATCCTAAATATGAAGTGGTCTTTGTATTTGCACTTTAATGTGTTGAAATCATAGCTTTCAGTGATCCAGGATTAGGCAGACTCTTTTATGCAATCTCTTGTTTCCAGTTAGAATAGAAGTCGTGTACTTTTGATAACATTAATTATAATATATTTTGAGCCCTGTGAGGTTGGTAACATTATTCCCATTTTATGAATGAGGAATGTGTGTTAAGGAGTTTGCCCAAGAGTCACATAGCAAGTCATAGTCATGCTCTCTGAAGCAGCAATAACTTGGCAATAAAATAAAAATGAAGCATCTTCTGTATGTGTTAACTTTTCAGTGACTGTTTATGCCTTCCAGTATTCTTTGTAAACCTTGAATTCTTTTTTTCACAGATGATTAAAGTTTATCAATTGTAAAGGTGGAGGAATTTGGGAACTAGACAGTGCACACATAAATAATAAATATGTTCTTCAAATATTGGGTGGGCTAATGTGGGAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTCGTCTCTAAAAATATGAAAAATAAAAAAAAAATTTTTTAAATGTGTGATATGTTTAGATGGAAATGAAACAATTTGTCACTGTCTAACATGACTTTTAGAAAAGATATTTTAATTACTAATGGGACATTCACATGTGTTTCAGCAAGGTGAAAAAATTATTCAGGAGTTCCTGTCCAAGGTGAAACAAATGCCCTTTACTGAAATGTCAGAAGAAAACATCACAATAAAGTTAAAACAGCTAAAAGCTGAAGTAATAGCAAAGAATAATAGCTTTGTAAATGAAATCATTTCACGAATAAAAGTTACTACGTGAAAAATCCCAGTAATGGAATGAAGGTAATATTGATAAGCTATTGTCTGTAATAGTTTTATATTGTTTTATATTAACCCTTTTTCCATAGTGTTAACTGTCAGTGCCCATGGGCTATCAACTTAATAAGATATTTAGTAATATTTTACTTTGAGGACATTTTCAAAGATTTTTATTTTGAAAAATGAGAGCTGTAACTGAGGACTGTTTGCAATTGACATAGGCAATAATAAGTGATGTGCTGAATTTTATAAATAAAATCATGTAGTTTGTGGAATTTGAGATGCATTGTAGTTCTTCGCAGTGTGACTTCAAATATTTTGGAAGAAACAAATAGCTCAGAGACCTCGTAAAATATCTTAAACTGGAGGGCTCCATGGAGATCATTGCGAGTGACTCCCCCAGAATGTCCATCTGTTGACAGGAGCCAGGCTGGCTGCATACGAATTAGCTAAGGAGCTTATTATATATCCAGAGTCCTACCGTGAGCCTCCATCCCGTCTGCCATTCTCCCATCCCTGGTCTATGATAAGACTTAGAAATCTGGATTTTAACAAAACGTTTCAGATTGAGAACCTTGATTTAGTCTACTTCTCCTATTTTACAATAAAGAGATGAAGCGGTTAAGAATTAGCTAATCCTACGCAAAGTGAGGGAAAAAGGACAGTCTTTTTAATAAATGCGGCGGGCTGGTGGGGTATCCATATAGGAAGAAATGACATTGGACCCCTACTCCATGTCATATATAAAAACCTCCACTTTGGGAGGCGAAGCAGGCAATCACTTGAACTCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGACAACATGACGAAACCCCATCTCTACAAAAATAAATGCAAAAATTAGCCGGGCATAGTGGTGCTTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACGTGATCTGGGAGAGGTTGAGGTTACAGTGAGCTGCACTCCATCCTGGGTAATACAGTGATAACTGTGTCTCAAACAAAACAAAACAAATCACCTTCAGTGATTTTTAGACCAAATGTACAAGGTAATACTCTCAAGGTTTTAATGTTTTATAGTTCTGCAGAAGATAACATAGGAAAATATTTTTATGTCCTTGGCTTTGGGAAGAATTTAAGTCACAGAAAAACACCATCCATAAAGTTTGACTTATTTAGCTATTTGAAATTAACAACTTCTATTAAAAGGCACCACAAGTGAAAAGACATGAATCGTAATGGAAGAACATACTGGTACGTTATAAAATATCAAAGAGTTGGGCATGGTGTCCCATGCTTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGCAGTTCAAGTCTCAGCAGTTCAAGTCCAGCCTGGGCAATATAGCAAGACTGCATTTCTTTTCTTCTTCTTTTTTAATACCTGGAATAAAGAACTCCTATAAAATCACTAAGAAAAGGGGTCACTTAAGAATCTCATTAACAAAAAGAATTTGAATATTTTTCCAAGGAAGATATGCAAATGGACTGTAAGCACATGAAAAGATGCAGATCAGGGAAATGCAAGTCAAAACCACAATGAGCTACAACTTCACACTGATTACGATAGTTAAAATCAAAAAGTCAGATGGTAAGTACTGGCAAGGAAGTGGAGAAATTGAAACTGTCATGCGCTCTTGGTGCGAATGTAAAATGGTGCAGCTGCTTTGGAAAACAGTCTGGCAGTTCCTCAGACAATTCCACTCCAACGTATATCCAAGTGGAATCACAACATATGTCCCCACAAACTTGTACATAAATGTTTATAGCAGGATTATTCATAATAGCCAAAAGGTGGAAACAACCCGAATGTCCATCAGCAGATGAATGCATAAATGAAACGTGGTCTATCCATACAATGGAGTATATTATTGAGCCATTAA
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pathogenic
35,159
Is the chromosome 2, position 47783223 variant in MSH6 (mutS homolog 6) clinically benign or pathogenic? If pathogenic, what condition(s) is associated?
benign
GTAAACTCATTTGGTAGCAAATTTTGACCTGAGGCTATTTATAGTCTATATTCTGTATTCTTTCTACTTAGTATGAATAAGCATGTAAGTTTTACTGCATGTTTGATTTCAGCATGTTCCCCCAGACTCTCTGGGGGTGTTTACGTATGCCGGTGGGGGAAAGAGACCAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCC
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benign
35,205
Is the variant located on chromosome 2 at position 47783239, gene MSH6 (mutS homolog 6), benign or pathogenic? If pathogenic, specify the disease(s) linked.
pathogenic; ['Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
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pathogenic
35,210
Variant chromosome 2, position 47783265, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? Disease(s)?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
AGTCTATATTCTGTATTCTTTCTACTTAGTATGAATAAGCATGTAAGTTTTACTGCATGTTTGATTTCAGCATGTTCCCCCAGACTCTCTGGGGGTGTTTACGTATGCCGGTGGGGGAAAGAGACCAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTC
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pathogenic
35,225
Benign or pathogenic: chromosome 2, position 47783290, gene MSH6 (mutS homolog 6) variant? Disease(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Endometrial_carcinoma', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
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pathogenic
35,236
The mutation in gene MSH6 (mutS homolog 6) at chromosome 2, position 47783312—clinically benign or pathogenic? If pathogenic, identify the related disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome']
TTTTACTGCATGTTTGATTTCAGCATGTTCCCCCAGACTCTCTGGGGGTGTTTACGTATGCCGGTGGGGGAAAGAGACCAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGC
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pathogenic
35,246
Variant on chromosome 2, at position 47783328, affecting MSH6 (mutS homolog 6): is it benign or pathogenic? If pathogenic, specify the associated disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
ATTTCAGCATGTTCCCCCAGACTCTCTGGGGGTGTTTACGTATGCCGGTGGGGGAAAGAGACCAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTG
ATTTCAGCATGTTCCCCCAGACTCTCTGGGGGTGTTTACGTATGCCGGTGGGGGAAAGAGACCAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGN
pathogenic
35,252
Evaluate if the mutation on chromosome 2 at position 47783333 in MSH6 (mutS homolog 6) is benign or pathogenic. Disease name(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
AGCATGTTCCCCCAGACTCTCTGGGGGTGTTTACGTATGCCGGTGGGGGAAAGAGACCAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCAC
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pathogenic
35,255
Is the genetic change at chromosome 2, position 47783342, within gene MSH6 (mutS homolog 6) benign or pathogenic? Name the disease(s) if pathogenic.
pathogenic; ['Gastric_cancer', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
CCCCAGACTCTCTGGGGGTGTTTACGTATGCCGGTGGGGGAAAGAGACCAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCG
CCCCAGACTCTCTGGGGGTGTTTACGTATGCCGGTGGGGGAAAGAGACCAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGN
pathogenic
35,259
Evaluate if the mutation on chromosome 2 at position 47783347 in MSH6 (mutS homolog 6) is benign or pathogenic. Disease name(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
GACTCTCTGGGGGTGTTTACGTATGCCGGTGGGGGAAAGAGACCAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGA
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pathogenic
35,263
Is the variant located on chromosome 2 at position 47783352, gene MSH6 (mutS homolog 6), benign or pathogenic? If pathogenic, specify the disease(s) linked.
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
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pathogenic
35,265
A genetic variant at chromosome 2, position 47783357, affecting gene MSH6 (mutS homolog 6)—is it benign or pathogenic? If pathogenic, identify the associated disorder(s).
pathogenic; ['Lynch_syndrome_5']
GGGTGTTTACGTATGCCGGTGGGGGAAAGAGACCAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCA
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pathogenic
35,270
Mutation found at chromosome 2 position 47783364, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, indicate the relevant disease(s).
pathogenic; ['Endometrial_carcinoma', 'Lynch_syndrome_5']
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pathogenic
35,273
Chromosome 2, position 47783376, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic variant? If pathogenic, what are the linked illness(es)?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
TGGGGGAAAGAGACCAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGG
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pathogenic
35,276
Is chromosome 2, position 47783376, gene MSH6 (mutS homolog 6) variant benign or pathogenic? If pathogenic, what condition(s) is it related to?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
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pathogenic
35,277
Chromosome 2, position 47783390, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic variant? If pathogenic, what are the linked illness(es)?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
CAACTCTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTG
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pathogenic
35,282
Determine whether the variant at chromosome 2, position 47783395, in gene MSH6 (mutS homolog 6) is benign or pathogenic. If pathogenic, identify the relevant disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
CTCAAATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACT
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pathogenic
35,287
Gene MSH6 (mutS homolog 6) variant at chromosome position 47783399 on chromosome 2: benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) is it associated with?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
AATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTG
AATATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGNNNNNNNNNNNNN
pathogenic
35,290
Evaluate if the mutation on chromosome 2 at position 47783401 in MSH6 (mutS homolog 6) is benign or pathogenic. Disease name(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
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TATTATCTCAAACAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACN
pathogenic
35,293
Is the genetic change at chromosome 2, position 47783413, within gene MSH6 (mutS homolog 6) benign or pathogenic? Name the disease(s) if pathogenic.
pathogenic; ['Endometrial_carcinoma', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome']
CAGTTGGTTTCACTGTGCTTGCTTGGGTAGCACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACCTCAAGTGGTCC
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pathogenic
35,300
Does the variant impacting MSH6 on chromosome 2, position 47783444, classify as benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) is it associated with?
pathogenic; ['Lynch_syndrome_5']
ACATATACCAAAATTGGAATGACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACCTCAAGTGGTCCACCCACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT
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pathogenic
35,315
Variant chromosome 2, position 47783465, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? Disease(s)?
pathogenic; ['Lynch_syndrome_5']
ACCCCTGCACAGGGATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACCTCAAGTGGTCCACCCACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCC
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pathogenic
35,322
Clinical impact (benign or pathogenic) of the variant at chromosome 2, location 47783478, gene MSH6: what disease(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome']
GATGAAATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACCTCAAGTGGTCCACCCACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCGCTAGTTA
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pathogenic
35,331
The genetic variant at chromosome 2, position 47783483, affecting gene MSH6: benign or pathogenic? Disease name(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Mismatch_repair_cancer_syndrome_3']
AATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACCTCAAGTGGTCCACCCACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCGCTAGTTAGTGGT
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pathogenic
35,334
Regarding the variant found on chromosome 2 at position 47783483 in gene MSH6: is it benign or pathogenic? If pathogenic, identify the disease(s).
pathogenic; ['Lynch_syndrome_5']
AATGCAAATTCGTGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACCTCAAGTGGTCCACCCACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCGCTAGTTAGTGGT
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pathogenic
35,335
Is the genetic change at chromosome 2, position 47783495, within gene MSH6 benign or pathogenic? Name the disease(s) if pathogenic.
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
TGAAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACCTCAAGTGGTCCACCCACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCGCTAGTTAGTGGTTTTGAGTAATGG
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pathogenic
35,343
For chromosome 2, position 47783497, gene MSH6: benign or pathogenic mutation? If pathogenic, what are the associated disease(s)?
benign
AAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACCTCAAGTGGTCCACCCACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCGCTAGTTAGTGGTTTTGAGTAATGGAT
AAGCATACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTATTGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACCTCAAGTGGTCCACCCACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCGCTAGTTAGTGGTTTTGAGTAATGGAT
benign
35,344
Determine whether the variant at chromosome 2, position 47783503, in gene MSH6 is benign or pathogenic. If pathogenic, identify the relevant disease(s).
benign
ACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACCTCAAGTGGTCCACCCACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCGCTAGTTAGTGGTTTTGAGTAATGGATTTCAAA
ACTGTATTTTTCTTAGCACATACCACCTTTGGCAATATTCTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGAGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCTACCACGCCAGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCCGCCCCCCCCCCGAAGTGCCGAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCCGCCTTTTTTTTTTAGATTGATTTTATTACTTGCCTAGCAAAGGAGAACCTTCTGGCAGAACAGTCTCCAAGAACAAGGCAAACAACTAATTTTACATAGGTTTTTACCAATGTACAGCTGTTGATTGTGACTGGTTTCCGGCAATCTGGATTTCACAATCTGGATAAGGGGACAAACAATTGTCTGTCTTCCACTATCTTTCTTGAATTTGAATAGAACCTTTTTATTCTCATAGCCTCTTAGCTTTCTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGCAAACGCTGCCTCCCAGGTTCAAGTTATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGGATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGACTAGGCTGGTCTTCAACGCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTCATAGTCTCTTAGCTTTCTAAAATTTGAAAAATCCTGTAAAGACACACCTGGGTCAAAGGGCTCAGATAACGGACTGTGGCCCTTAAGTACTTACGTCACAGGTTATTGAGAGGATCGATTTAGTTACCAGATGTAAAATGCTGGGATCAGTGCCTGGCAAAGGAAAACTTTGTACAGCTGCAGGCTTTCACCATACACAACAGCATCGCTAACGAATGCTATTACAATATTCATTTAGCGTTTACCAAGTGCCTACTCTATACAAATCTTGAGAATACAACGTGAAGGTGAACTGCTGACTAAAGTTTGGTCCCTTTCGCTCCGTCTCCTTGCGAAAATGCTCTAACGGCAGGAGGTCACGCGAGCGCTGGACGCGTTTCTCCCCGCGAGCCCCTTTCCGAGGCCTTTCGGGTCCCCCCGGTTATCCCCGCCCGGGCGGTGCGCGCCCCCGCTGTTCCCGCTTCCGCTCCAGAGAGGCAGGGCTTTCCGAGCCTGCTAGCCCCGCGGCCGCAACTAACCCCGGGTCGGAGTGTTCCGGCCCGGCCAGCCCCGCGGCGTGAGGGAAGGGGAGCTCAGCAGTTCCCCGCGCGGGGCCCAGGCGTCGGCGGCAGGGCGGGCCCCTCACCGCCAGCGTGCCAGCCCCGCCCCTACCCACCAGTGTGCCAGCCCCGCCCTTCCCCACGTCGCCGCGCGCCCGGGGGCGGGGCCTGGCGCGCACCGCCCGCGCACGGCGAGGCGCCTGTTGATTGGCCACTGGGGCCCGGGTTCCTCCGGCGGAGCGCGCCTCCCCCCAGATTTCCCGCCAGCAGGAGCCGCGCGGTAGATGCGGTGCTTTTAGGAGCTCCGTCCGACAGAACGGTTGGGCCTTGCCGGCTGTCGGTATGTCGCGACAGAGCACCCTGTACAGCTTCTTCCCCAAGTCTCCGGCGCTGAGTGATGCCAACAAGGCCTCGGCCAGGGCCTCACGCGAAGGCGGCCGTGCCGCCGCTGCCCCCGGGGCCTCTCCTTCCCCAGGCGGGGATGCGGCCTGGAGCGAGGCTGGGCCTGGGCCCAGGCCCTTGGCGCGCTCCGCGTCACCGCCCAAGGCGAAGAACCTCAACGGAGGGCTGCGGAGATCGGTAGCGCCTGCTGCCCCCACCAGGTAGCGGGGTGGGGTGGGGTCGAAGGCGGGGGCATAGCGGCGGGGCGCTTGGAACCCGGCGAGGGGAGGCTCGCACAGGGGGTTGGGGGGGTGCACGGCCTGGCCCTGGGCTCGGAGGAGGCGGGGCCGCAGAGTTGGCTTGAATGAGTGCAGGGGTCGAGTCTGGAGCATTTGGGGGTGTAGCTTGTAAACAGGGTCGGAGGAGAGAGGCTGTGCAGGAAGAGGGCTGCAGGGGAGACGCGGAGAGTTCGGGCCTTTTGGAGGGAGGAGACGCGTCCCGCCAGGTGGGGGTGCTGGGCTAAGGAAGGGGCGACGCGCGCAGCTCCGGGTGGGGAGGGGGCCTGGGAGGTGGGAGCACTGGGGGTGGGGCGAGAAGGGGAAGGCGCCCGGCCCACTTGGTGGGCGGGGCGGGGGGCGGGGTGGCGGGAAGGAGGAATGCCTGCGGGAGGCCGAACGGGGAGAGTCCGGTGGTGTGGGGTGCGAAAGGAGGTTCCTCGGCCGGCGCGGAGATAGTGAGTTGGGGCTCCAGTAGTCGATCGAGGTAGACACTTAGAGGTAGTTAAGAGCCGCGGTCGCCGAGACGCCTTGGGGACGGTGGGCCTTCGGCCTAGGTGAGGGGCCGCCGAGGGGGTGGGCCACGAGCTGCGAGCGCGGGGGGGTGTGTCACCATGGGGACCGCGGGGCCTAATTGGGCGGGGCGGGGCCGTGGGGAGCCGAAGTGCTGGGATCCGGCTGGGTCCTTCGGTAGGTAGGCTGCACGTGCACCGAGACGAAGATAGAATATTTTGACGTATGTGGAAATTCGTGTCGAGTGGAAAATATTTTATTTTATGAAATAGTGTAATTTTTATGGGGCACCACTGGGCTTTTAGAGGCCTTAATCGGGCGCTGGACAAAGATGTGTGGACGTGAGTGACTCCGGGGAAGCCTGTCGGGAGTTGTCCTCACTTTATGGGCAGTTAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGAGAGAGAGTTTCGCTCAAGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACCGCAATCTCCGCGTCCCGGCTTCAAGCGATTCCCCAGCTTCAGCCTCCCGAGTAGTCGGGATTACAGGAATGCGCCCCCACACCCCGCCAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGGAATTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCTAGCCACCGCGCCCGGTCTGTTTAGGGCTTTTTATCCGGGCAGCTGGCGACATTTTGAAAAGCTTGCTTTTGCTGTTTGCCAGATACATATATATGTATTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTTTTGTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCGTTCTTGGCTCACCACAACCTCTGTCTCTGGATCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCCCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCTCTTGATCGGCCCGCATTGGCCTACCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGAGCCCGGCCGTTTGTCAGATACTAAACACAAAGTTTAATGGTCGCTATTTGAACAAACGAAGAAATAAAGGCTCAGAAAAAATAACTCATTCAAGATAAGAGCCAGTTCGTGTTTTTTGTTTGGTTTTGTTTTGAAATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCGCTTTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCCGCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGTGTGCCCACCGCGGTCCGGCTGATTTTTCACCATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAACTGCTGACCTCAAGTGGTCCACCCACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCGCTAGTTAGTGGTTTTGAGTAATGGATTTCAAAN
benign
35,348
Is the genetic change at chromosome 2, position 47790909, within gene MSH6 (mutS homolog 6) benign or pathogenic? Name the disease(s) if pathogenic.
benign
TGCGCCCGGCCCAGCATACTGCTATTTCTTTCTTTCTTTCTTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGT
TGCGCCCGGCCCAGCATACTGCTATTTCTTTCTTTCTTTCTTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAG
benign
35,363
The chromosome 2, position 47790926 genetic variant in gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, indicate disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
ACTGCTATTTCTTTCTTTCTTTCTTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCT
ACTGCTATTTCTTTCTTTCTTTCTTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTNNNNNNNNNN
pathogenic
35,371
Variant in gene MSH6 (mutS homolog 6), located at chromosome 2 position 47790927: benign or pathogenic? What disease(s) does it cause if pathogenic?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
CTGCTATTTCTTTCTTTCTTTCTTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTA
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pathogenic
35,373
Evaluate if the mutation on chromosome 2 at position 47790928 in MSH6 (mutS homolog 6) is benign or pathogenic. Disease name(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
TGCTATTTCTTTCTTTCTTTCTTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAA
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pathogenic
35,374
Considering the variant on chromosome 2, location 47790954, involving gene MSH6 (mutS homolog 6), would you classify it as benign or pathogenic? What disease(s), if any, does a pathogenic variant indicate?
pathogenic; ['Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
CCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTA
CCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTANNNNNNNNNN
pathogenic
35,379
Clinical impact (benign or pathogenic) of the variant at chromosome 2, location 47790974, gene MSH6 (mutS homolog 6): what disease(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Familial_cancer_of_breast']
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCT
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pathogenic
35,384
The chromosome 2, position 47790978 genetic variant in gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, indicate disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTN
pathogenic
35,387
Does the variant impacting MSH6 (mutS homolog 6) on chromosome 2, position 47790994, classify as benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) is it associated with?
pathogenic; ['Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
TTGTGAGACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGC
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pathogenic
35,393
The genetic variant at chromosome 2, position 47791001, affecting gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? Disease name(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Endometrial_carcinoma', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome']
ACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCAT
ACGGAGTCTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCCCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGC
pathogenic
35,395
Assess the variant on chromosome 2, position 47791008, impacting MSH6 (mutS homolog 6): is it benign or pathogenic? If pathogenic, specify the associated condition(s).
pathogenic; ['Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
CTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCT
CTGTCGTCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTN
pathogenic
35,398
A genetic variant on chromosome 2, position 47791015, affects the gene MSH6 (mutS homolog 6). Is this variant benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) does it cause?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
CCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCT
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pathogenic
35,399
Located at chromosome 2 position 47791020, the variant affecting gene MSH6 (mutS homolog 6)—benign or pathogenic? If pathogenic, which disease(s) does it relate to?
pathogenic; ['Endometrial_carcinoma', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5', 'Ovarian_neoplasm']
CTGGAATGCAGTGGCGTTTTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAAT
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pathogenic
35,400
Evaluate this variant at chromosome 2, position 47791058, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, what are the disease connection(s)?
pathogenic; ['Carcinoma_of_colon', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
CTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTG
CTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGNN
pathogenic
35,411
Evaluate this variant at chromosome 2, position 47791058, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, what are the disease connection(s)?
pathogenic; ['Endometrial_carcinoma', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
CTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTG
CTGCTGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGNNNNNNNNNNNNNN
pathogenic
35,412
Clinical classification of chromosome 2, position 47791062, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? Disease(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
TGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGT
TGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGG
pathogenic
35,415
Classify the chromosome 2 variant at position 47791062 affecting gene MSH6 (mutS homolog 6) as benign or pathogenic. If pathogenic, which disease(s) is associated?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
TGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGT
TGCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTN
pathogenic
35,416
Is the genetic mutation found on chromosome 2 at position 47791084, within the gene MSH6 (mutS homolog 6), considered benign or pathogenic? If pathogenic, specify the associated disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
CTGCTTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGG
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pathogenic
35,419
The mutation in gene MSH6 (mutS homolog 6) at chromosome 2, position 47791088—clinically benign or pathogenic? If pathogenic, identify the related disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
TTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAA
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pathogenic
35,420
A genetic variant on chromosome 2, position 47791090, affects the gene MSH6 (mutS homolog 6). Is this variant benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) does it cause?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
CAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACA
CAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAAC
pathogenic
35,423
Considering the genetic mutation at chromosome 2, position 47791105, impacting MSH6 (mutS homolog 6): is it clinically benign or pathogenic? Name the associated disease(s) if pathogenic.
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome']
CTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTC
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pathogenic
35,427
Variant chromosome 2, position 47791105, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? Disease(s)?
pathogenic; ['Endometrial_carcinoma', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
CTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTC
CTGGGATTATAGGCCTCTGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCNN
pathogenic
35,428
A mutation at chromosome position 47791122 on chromosome 2 in gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, which disease(s) is it linked to?
pathogenic; ['Lynch_syndrome_5']
TGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA
TGCCACTGCACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAN
pathogenic
35,435
Located at chromosome 2 position 47791141, the variant affecting gene MSH6 (mutS homolog 6)—benign or pathogenic? If pathogenic, which disease(s) does it relate to?
benign
TTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGG
TTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGNN
benign
35,441
Variant in MSH6 (mutS homolog 6), chromosome 2, position 47791142—is this benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) is linked?
benign
TTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC
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benign
35,443
Determine whether the variant at chromosome 2, position 47791142, in gene MSH6 (mutS homolog 6) is benign or pathogenic. If pathogenic, identify the relevant disease(s).
benign
TTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC
TTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCNNNNNNNNNNNN
benign
35,444
Determine if the mutation at chromosome 2, position 47791154 in gene MSH6 (mutS homolog 6) is benign or pathogenic. If pathogenic, what disease(s) is associated?
benign
GGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACATGCCTGTAA
GGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACATGCCTGTAANN
benign
35,445
Determine whether the variant at chromosome 2, position 47791154, in gene MSH6 (mutS homolog 6) is benign or pathogenic. If pathogenic, identify the relevant disease(s).
benign
GGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACATGCCTGTAA
GGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCACCGCACCCGGCCCATACTGCTATTTCTTAACAGCAGAGAAATTATGTGTCAGATTCTGTAAGTGTAATGGTATATAAAGGATAAAATGATGTTGAAAAACAAAATTTTTTGTTTAAATGCTTATGTTTCTAATATTTTATTTCAGAAAGGAATTTATTTCAAAACTGATAATGGTTGGATCCAGCTTTTCACACAAACTTTTTTTTCCTAGTGAGGATGCACATTTATCCTGTAAACAAATGGAAGACATTATTTTTTTAATTGCTTGCTTAGAAATGAAATAATTCTTTTCTAATGATCTTTTAAAGCATGAGACCTCATACATCATTTAAAACAATTTATACTGTATTTTACACATGACAAAGTTCTAAGGTAACAGCCCTTTTCTAAGACTAAAGTTACAGTCCTCCCTTTGTATCTGAGGGGGATTGGTTGCAGGACCCCCCTGTGAATACCCAAATCCTTGGATGTCCAAGTCCCTTATGAGATGTAGTATTTGCATATAACCTATACACATCTTCCCCTGTACTTTATCTCTAGATTACGTACAATACCTAATAGAATGTAAATGCTTTGAAATTAGTTGTTCAGCTGTATTTTAAATTTTGTATTTTTTTTCCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTACAGTGATCACAGCTCACTGCACCTTTAACCTCCCAGGCTCAAGCTGTCCTGCCTCGGCCTCCCCAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCATCATACCTGGTCACTGTTTTTTATTGGTTTTAAATTTTTGATTTAAAATTTTTAATCTAGGTTGGTTGAATCTGGACTGGAACCCAAGGATATGTTTGTTGAGCATACTGTATTTACTTTGGAATACAACTAGAATGCTTAACTTGTATGTTAAAAATACTTTATTTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGAATCATTTGAGGTCAGGAGTTTAAGACGAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGACTCTACAAAAAAAAGGTAAAAATAAGCCAGGTGTGATGGCGTGTGCCTGTAGTCTTGGCTATTCAGGAGGCTGAGACACAAGAATCGCTTGAACCGGGGAGGCACGTTACGCCCTCAGTTGTTGACTTGAGTTTTTCCGTAGTTTGTAGGGGGAGGGTAATAGAGTATTAGGTAGCTTTTGGAATACATAGGAGTGTAACTGGAAAAAGATTCCAAGCAAGTCTAATGAATTAGATAATTTACCTAATTAGTAAATTATGTAATCAGTATGCTTTATAATAATATTGTGAGTTAGATCCTGTTTCTGATATGTACATACCATATTGTATAGGTGCTACTAATTTGGAGAGCATATACAGTGAGTCCATGCCTTTTTCCTGCCATCAGCATTATACCAAAATTCTGCCATGGTTTTTAAACTTTGATTCTGAGAAAGTTTCTCACCCTAATAACATAACTATATTTGTGTTTGTCTTCATAGTTAAATATGCATTATGATATCAGCTTGCATACATTTTTTAAATGACTTGAATATCTGACTTTAAAAATTATTCTAGAATTTCTGTGCTTCAATATTAATGCCAGAAGACTTGGAATTGTTTATTTGTAGGTAACTGCCTTTAAGGAAACTTGACCAAATATTAACTAAGTTATGTATTTCCTTTTGGCAACAGTTGTGACTTCTCACCAGGAGATTTGGTTTGGGCCAAGATGGAGGGTTACCCCTGGTGGCCTTGTCTGGTTTACAACCACCCCTTTGATGGAACATTCATCCGCGAGAAAGGGAAATCAGTCCGTGTTCATGTACAGTTTTTTGATGACAGCCCAACAAGGGGCTGGGTTAGCAAAAGGCTTTTAAAGCCATATACAGGTAAGAGTCACTACTGCCATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAACAGACAGACAGGCAGACTTTTTTCTATATGATGAAATTAAGTGTATTTTACCCCAGTAAATTGCAAGGGGTGGCAGTTGTGAAAGCTTCTGGCATGGGAAAGGGATGTAACATGGTCTTTAGCTGGTTTGTTTTGTGGAATGGAATTTTTATTTCTGTCCTTTGAGTGACTTACAGCAATATTATACCCTTAATAAGGGTAAACTAAACTGTCCCCCCATCTTGAAGGGTCCAAGAGAAAGTTAATGTCATCAGGATACATAGCCTATAGATAGCGACATTCTCTAGGGAAAGATGGAGATGCGCACTACCTGGCCTTCAAACTACTCACTAATGAACACATCTGAGTTGAGTTTCACACCAAACTCCTGGAACCATAACTTTCTTTTCCCAGATCTAGTCTTGTTTATCACAGACATCAACAGCCTGGCATGTTTAGCCTCACTTGGGCTAGGTGCACCCCATCGTCTCTTGTACAAGTTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCCCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGAGTTTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTTGGGATTATAGGCACACGCCACGTTGCCTGGCTATATATATATATTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTTTGGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCGCCACCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCTAAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCAAGCCCAGCTAATTTTTTATTTCTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTGCTGACCTCCAGTAATCCACCCACCTCCCCCTACCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATTTCGGCCTCCCAAGAGTCTCCAGTCTAGTACGTTGTCGTACTCGGTGTTGTAAAATCCAAACAAGGGTCAGTTTCCCAGGTAACTGGGAAATTCCCAGAATCACACTCTTTCGTCATAGTGCTCATCCTACAAAAAAGGATTGGGGGCATTTTGTCTAAAATTAAATGTAAATGGTGATCTGACATACAGGTGGAAAGAGAATTGGGAAGTTTTGTTCTCTCTTCTACCAACTTGCCACATAATCTTGGCCAAGCAAAGTAACTTGTTTTTTCTTTTAATCTTTTTAAAAGAAATAGAGACACAGTTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGCCTGAGCTCAAGCAGTCTGCCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTACAGGCATAAGCCACCATGCCCCTGGGCTCGGCCAACTTTTTCGTTTTCTTTTCAAGAGATGGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGTATAGTGTTGGGATCATAGCTCACTGGAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCCCCCCTGTTTTAGCCTCCTCAGTAACCGGGACTAGAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAGATGACGGTCTTGCTATGTTGCCCCCAGGGTGGTCTTGAATTCTTGGCCTCCAGTGATCCTTCTGCATCAGGCTCCCAAGTAGTTGGGTGATCTGGCTAAAGTAACTTATTTTCTGATACTGTTTACTTATATTTAGAATGAATCTCATTGGGGTTGCACTGGGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGACTAGCCTGGCAAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACATGCCTGTAANNNN
benign
35,446
The chromosome 2, position 47795846 genetic variant in gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, indicate disease(s).
benign
TCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTG
TCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
benign
35,452
Is the variant located on chromosome 2 at position 47795882, gene MSH6 (mutS homolog 6), benign or pathogenic? If pathogenic, specify the disease(s) linked.
benign
GATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCAC
GATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACN
benign
35,454
Is the chromosome 2, position 47795901 variant in MSH6 (mutS homolog 6) clinically benign or pathogenic? If pathogenic, what condition(s) is associated?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
CCCAAGTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTA
CCCAAGTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAACAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAN
pathogenic
35,462
Variant chromosome 2, position 47795903, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? Disease(s)?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
CAAGTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGT
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pathogenic
35,464
Does the variant on chromosome 2 at location 47795903 affecting gene MSH6 (mutS homolog 6) have a clinical significance of benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) is associated?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
CAAGTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGT
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pathogenic
35,465
Gene MSH6 (mutS homolog 6) variant at chromosome 2, position 47795903—is it benign or pathogenic? If pathogenic, what are the associated condition(s)?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
CAAGTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGT
CAAGTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTNNNN
pathogenic
35,467
A mutation at chromosome position 47795906 on chromosome 2 in gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, which disease(s) is it linked to?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
GTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTT
GTAGCTGTGATTATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCT
pathogenic
35,468
The chromosome 2, position 47795918 genetic variant in gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, indicate disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
ATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTC
ATAGGCGCCCACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCN
pathogenic
35,474
Clinical significance of chromosome 2, position 47795927, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? Name the disease(s) if pathogenic.
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
CACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCC
CACCACCAGGCCCAGCTGATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACC
pathogenic
35,478
Does the variant on chromosome 2 at location 47795927 affecting gene MSH6 (mutS homolog 6) have a clinical significance of benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) is associated?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
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pathogenic
35,479
Variant in MSH6 (mutS homolog 6), chromosome 2, position 47795945—is this benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) is linked?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
ATTTTTGTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTT
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pathogenic
35,484
Variant in gene MSH6 (mutS homolog 6), located at chromosome 2 position 47795951: benign or pathogenic? What disease(s) does it cause if pathogenic?
pathogenic; ['Hereditary_nonpolyposis_colon_cancer', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
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GTATTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCANNNN
pathogenic
35,487
Determine whether the variant at chromosome 2, position 47795954, in gene MSH6 (mutS homolog 6) is benign or pathogenic. If pathogenic, identify the relevant disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Lynch_syndrome', 'Lynch_syndrome_5']
TTTTTCAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAA
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pathogenic
35,488
Mutation at chromosome 2, position 47795959, within MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, indicate the disease(s).
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
CAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTG
CAGTAGAGTTGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTGN
pathogenic
35,489
Clinically, how would you classify the variant at chromosome 2, position 47795968, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, specify the associated illness(es).
pathogenic; ['Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
TGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTGCTTTCCCTG
TGAGGTTTCACCACGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTGCTTTCCCT
pathogenic
35,491
Does the variant impacting MSH6 (mutS homolog 6) on chromosome 2, position 47795983, classify as benign or pathogenic? If pathogenic, what disease(s) is it associated with?
pathogenic; ['Endometrial_carcinoma', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
TTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTGCTTTCCCTGGGCAGAGAATCCTTG
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pathogenic
35,494
Clinical impact (benign or pathogenic) of the variant at chromosome 2, location 47796012, gene MSH6 (mutS homolog 6): what disease(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Endometrial_carcinoma', 'Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colon_cancer', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
TTAAGTGATCCGTCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTGCTTTCCCTGGGCAGAGAATCCTTGCCCTTCTTGTATTATGTCACTTTGTGGGG
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pathogenic
35,501
Is the genetic change at chromosome 2, position 47796019, within gene MSH6 (mutS homolog 6) benign or pathogenic? Name the disease(s) if pathogenic.
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome', 'Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms']
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pathogenic
35,503
The genetic variant at chromosome 2, position 47796035, affecting gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? Disease name(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Lynch_syndrome_5']
CTCCCAAAGTGCTGGGATTAGGTGTGAGCCACTGGGCTGGCCCAGAATGATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTGCTTTCCCTGGGCAGAGAATCCTTGCCCTTCTTGTATTATGTCACTTTGTGGGGTTGGTGTCTGCTACACTTACAGC
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pathogenic
35,509
Benign or pathogenic: chromosome 2, position 47796062, gene MSH6 (mutS homolog 6) variant? Disease(s) if pathogenic?
pathogenic; ['Hereditary_nonpolyposis_colorectal_neoplasms', 'Lynch_syndrome_5']
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pathogenic
35,517
Chromosome 2, position 47796084, gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic variant? If pathogenic, what are the linked illness(es)?
benign
ATTTTTAAAAAGAGATCAGTAAGGCCAGGCAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTAAGGTAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTGCAGACAAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGGTGAGGCAGAATTGCTTGAACCCGGGAGTCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGACCCACTTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACTGCAATCTCTGTCTCCGGGGTTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGTCTCCTTAGTAGCTGAGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGATGGATGTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTTAAACTCGTGACCTGAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCCTAAAGTTGTATTTTGATGGAACGAACTGTTTTGAGAAATAAATTTTAACGCGTTGAGTCTGAACTGGGCTGCCCTTTCAAAATGTGAAGGCCCCTTAAAGTAGCACATTGGTTGGTTATTCTTTTATTTATTTAGATATATCTGATCTAGTTGTCTTTGGGACAAACTCATATTTAATATCATAGCTGCATGTAACTGACAGTGTAGTCTTTGTCTTCCTGAAGTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCTTCTGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCATTGTGCCCAGCTAGTAAGTTTTTAAGAAAGATTCTCAAACCTCTTTTAAATCGTCTGCCTCACTTGAAGAGGTATGCCCTACCTGTTTAGGGCTGTAGACCCAGGTCATTAGAAGACAGACTAAGTAGTCCTGGGTGAACCCATAGGGCACCTTCAAGGAGGTAAAATTGGTGATTTTAGTTTCACCAGTAGTTTTTCCCTGAATATTTATTCCTTTTGTGCTTTATTGATCTATCTATATCAATAAAAAGTAATGGGGCATAACAAATTATACTTGTCATTCTTGTTCATTAGGGCAAATGTTGTAGGTTGAGTCAAGTGTCCAGCCAACAAGTTATTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATACATTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGAGACAGGGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTTAAGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCACCCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCACCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTAGTCCGCCCACCTAAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCTGGCATATATATATTTTAAGATAGAGATGGGGTTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCTCTGCACCCGGCCCTTATTGTTTATAAATACATTTCTTTCTAGGTTCAAAATCAAAGGAAGCCCAGAAGGGAGGTCATTTTTACAGTGCAAAGCCTGAAATACTGAGAGCAATGCAACGTGCAGATGAAGCCTTAAATAAAGACAAGATTAAGAGGCTTGAATTGGCAGTTTGTGATGAGCCCTCAGAGCCAGAAGAGGAAGAAGAGATGGAGGTGGGACACGGCAAGCATTCAGTTGTTATTTATGTTAGGGTGATGGGGGAAGAAAGGGGGAGGGTGTATTAACAAGATACCTTGTTTTATATATGTGTGTGTATATGTATTATTTTATTATACATACATGCATACTTCTGTAGTTCCCTGGACTGTAGGATAAGTTAGGTTACTTAGAATCTCAACAGCTAGCATCGTTTTTACTTAGGTTTTCAAGCCTACTGGCAGGGTAAGCAAGAGGTAGTACCATTTTGGTAAGAAGTAGAGAGCTAGGGACAGTAAAGATGGAGTAATATATATATGAGGGTATAGTCAGGCCCTAGAAATTAATTATCCAGTTTTATGCTTTTTATAAAAAAACTGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGTTCAAGGGATCTGCCCACCTGGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGCACCCAGCCCCAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTGCTTTCCCTGGGCAGAGAATCCTTGCCCTTCTTGTATTATGTCACTTTGTGGGGTTGGTGTCTGCTACACTTACAGCAAGTCCAGAGATTTTTTTTCCACCACGTTTGCAGGAGAACTATTGGCAT
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benign
35,528
A genetic variant at chromosome 2, position 47798591, affecting gene MSH6 (mutS homolog 6)—is it benign or pathogenic? If pathogenic, identify the associated disorder(s).
benign
CAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTGCTTTCCCTGGGCAGAGAATCCTTGCCCTTCTTGTATTATGTCACTTTGTGGGGTTGGTGTCTGCTACACTTACAGCAAGTCCAGAGATTTTTTTTCCACCACGTTTGCAGGAGAACTATTGGCATGGAAAATGACAATTGTTTTAATGTCAAGTGAAACTGAAGTTGATGTTCATTGAGAGGTTTCTAATTTCTAGAGGTGGGTTCTTTTTTTGGCATATGAAGTTGCAGCATATTAAGAGAATTTACAGTAGTACAGATGGGGTTATCCCATCCACAACTTATGATGGGGTTACATAAACTAAAAACGTGTTTAATACACCTACCCCACCGAATATTGTAGCTTGGGCGTAGCCTAACCTATCTCAGACGTGCTCAGAACACTTAAATGTTAGCCTAAAGTTGGGCAAGATCATCTAACACAAAGCCTATTTTATAATAAGGAATTGCCTATCTCATGTAATTCATCGAATACTGTACTAAAAATGAAAAACAGTGGCTGCACGGGTACCATTATAAAGTCAAAAAATCATAAGTTGAACTGTCTTACATTATGGTTTTCCAAATTTTGATTTGTTTTTAAATACTCTTTCCTTGCCTGGCAGGTAGGCACAACTTACGTAACAGATAAGAGTGAAGAAGATAATGAAATTGAGAGTGAAGAGGAAGTACAGCCTAAGACACAAGGATCTAGGCGAAGTAGCCGCCAAATAAAAAAACGAAGGGTCATATCAGATTCTGAGAGTGACATTGGTGGCTCTGATGTGGAATTTAAGCCAGACACTAAGGAGGAAGGAAGCAGTGATGAAATAAGCAGTGGAGTGGGGGATAGTGAGAGTGAAGGCCTGAACAGCCCTGTCAAAGTTGCTCGAAAGCGGAAGAGAATGGTGACTGGAAATGGCTCTCTTAAAAGGAAAAGCTCTAGGAAGGAAACGCCCTCAGCCACCAAACAAGCAACTAGCATTTCATCAGAAACCAAGAATACTTTGAGAGCTTTCTCTGCCCCTCAAAATTCTGAATCCCAAGCCCACGTTAGTGGAGGTGGTGATGACAGTAGTCGCCCTACTGTTTGGTATCATGAAACTTTAGAATGGCTTAAGGAGGAAAAGAGAAGAGATGAGCACAGGAGGAGGCCTGATCACCCCGATTTTGATGCATCTACACTCTATGTGCCTGAGGATTTCCTCAATTCTTGTACTCCTGGGATGAGGAAGTGGTGGCAGATTAAGTCTCAGAACTTTGATCTTGTCATCTGTTACAAGGTGGGGAAATTTTATGAGCTGTACCACATGGATGCTCTTATTGGAGTCAGTGAACTGGGGCTGGTATTCATGAAAGGCAACTGGGCCCATTCTGGCTTTCCTGAAATTGCATTTGGCCGTTATTCAGATTCCCTGGTGCAGAAGGGCTATAAAGTAGCACGAGTGGAACAGACTGAGACTCCAGAAATGATGGAGGCACGATGTAGAAAGATGGCACATATATCCAAGTATGATAGAGTGGTGAGGAGGGAGATCTGTAGGATCATTACCAAGGGTACACAGACTTACAGTGTGCTGGAAGGTGATCCCTCTGAGAACTACAGTAAGTATCTTCTTAGCCTCAAAGAAAAAGAGGAAGATTCTTCTGGCCATACTCGTGCATATGGTGTGTGCTTTGTTGATACTTCACTGGGAAAGTTTTTCATAGGTCAGTTTTCAGATGATCGCCATTGTTCGAGATTTAGGACTCTAGTGGCACACTATCCCCCAGTACAAGTTTTATTTGAAAAAGGAAATCTCTCAAAGGAAACTAAAACAATTCTAAAGAGTTCATTGTCCTGTTCTCTTCAGGAAGGTCTGATACCCGGCTCCCAGTTTTGGGATGCATCCAAAACTTTGAGAACTCTCCTTGAGGAAGAATATTTTAGGGAAAAGCTAAGTGATGGCATTGGGGTGATGTTACCCCAGGTGCTTAAAGGTATGACTTCAGAGTCTGATTCCATTGGGTTGACACCAGGAGAGAAAAGTGAATTGGCCCTCTCTGCTCTAGGTGGTTGTGTCTTCTACCTCAAAAAATGCCTTATTGATCAGGAGCTTTTATCAATGGCTAATTTTGAAGAATATATTCCCTTGGATTCTGACACAGTCAGCACTACAAGATCTGGTGCTATCTTCACCAAAGCCTATCAACGAATGGTGCTAGATGCAGTGACATTAAACAACTTGGAGATTTTTCTGAATGGAACAAATGGTTCTACTGAAGGAACCCTACTAGAGAGGGTTGATACTTGCCATACTCCTTTTGGTAAGCGGCTCCTAAAGCAATGGCTTTGTGCCCCACTCTGTAACCATTATGCTATTAATGATCGTCTAGATGCCATAGAAGACCTCATGGTTGTGCCTGACAAAATCTCCGAAGTTGTAGAGCTTCTAAAGAAGCTTCCAGATCTTGAGAGGCTACTCAGTAAAATTCATAATGTTGGGTCTCCCCTGAAGAGTCAGAACCACCCAGACAGCAGGGCTATAATGTATGAAGAAACTACATACAGCAAGAAGAAGATTATTGATTTTCTTTCTGCTCTGGAAGGATTCAAAGTAATGTGTAAAATTATAGGGATCATGGAAGAAGTTGCTGATGGTTTTAAGTCTAAA
CAGCTTTATGCTTTTAATTCTAAAACTTTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTGCTTTCCCTGGGCAGAGAATCCTTGCCCTTCTTGTATTATGTCACTTTGTGGGGTTGGTGTCTGCTACACTTACAGCAAGTCCAGAGATTTTTTTTCCACCACGTTTGCAGGAGAACTATTGGCATGGAAAATGACAATTGTTTTAATGTCAAGTGAAACTGAAGTTGATGTTCATTGAGAGGTTTCTAATTTCTAGAGGTGGGTTCTTTTTTTGGCATATGAAGTTGCAGCATATTAAGAGAATTTACAGTAGTACAGATGGGGTTATCCCATCCACAACTTATGATGGGGTTACATAAACTAAAAACGTGTTTAATACACCTACCCCACCGAATATTGTAGCTTGGGCGTAGCCTAACCTATCTCAGACGTGCTCAGAACACTTAAATGTTAGCCTAAAGTTGGGCAAGATCATCTAACACAAAGCCTATTTTATAATAAGGAATTGCCTATCTCATGTAATTCATCGAATACTGTACTAAAAATGAAAAACAGTGGCTGCACGGGTACCATTATAAAGTCAAAAAATCATAAGTTGAACTGTCTTACATTATGGTTTTCCAAATTTTGATTTGTTTTTAAATACTTTCCTTGCCTGGCAGGTAGGCACAACTTACGTAACAGATAAGAGTGAAGAAGATAATGAAATTGAGAGTGAAGAGGAAGTACAGCCTAAGACACAAGGATCTAGGCGAAGTAGCCGCCAAATAAAAAAACGAAGGGTCATATCAGATTCTGAGAGTGACATTGGTGGCTCTGATGTGGAATTTAAGCCAGACACTAAGGAGGAAGGAAGCAGTGATGAAATAAGCAGTGGAGTGGGGGATAGTGAGAGTGAAGGCCTGAACAGCCCTGTCAAAGTTGCTCGAAAGCGGAAGAGAATGGTGACTGGAAATGGCTCTCTTAAAAGGAAAAGCTCTAGGAAGGAAACGCCCTCAGCCACCAAACAAGCAACTAGCATTTCATCAGAAACCAAGAATACTTTGAGAGCTTTCTCTGCCCCTCAAAATTCTGAATCCCAAGCCCACGTTAGTGGAGGTGGTGATGACAGTAGTCGCCCTACTGTTTGGTATCATGAAACTTTAGAATGGCTTAAGGAGGAAAAGAGAAGAGATGAGCACAGGAGGAGGCCTGATCACCCCGATTTTGATGCATCTACACTCTATGTGCCTGAGGATTTCCTCAATTCTTGTACTCCTGGGATGAGGAAGTGGTGGCAGATTAAGTCTCAGAACTTTGATCTTGTCATCTGTTACAAGGTGGGGAAATTTTATGAGCTGTACCACATGGATGCTCTTATTGGAGTCAGTGAACTGGGGCTGGTATTCATGAAAGGCAACTGGGCCCATTCTGGCTTTCCTGAAATTGCATTTGGCCGTTATTCAGATTCCCTGGTGCAGAAGGGCTATAAAGTAGCACGAGTGGAACAGACTGAGACTCCAGAAATGATGGAGGCACGATGTAGAAAGATGGCACATATATCCAAGTATGATAGAGTGGTGAGGAGGGAGATCTGTAGGATCATTACCAAGGGTACACAGACTTACAGTGTGCTGGAAGGTGATCCCTCTGAGAACTACAGTAAGTATCTTCTTAGCCTCAAAGAAAAAGAGGAAGATTCTTCTGGCCATACTCGTGCATATGGTGTGTGCTTTGTTGATACTTCACTGGGAAAGTTTTTCATAGGTCAGTTTTCAGATGATCGCCATTGTTCGAGATTTAGGACTCTAGTGGCACACTATCCCCCAGTACAAGTTTTATTTGAAAAAGGAAATCTCTCAAAGGAAACTAAAACAATTCTAAAGAGTTCATTGTCCTGTTCTCTTCAGGAAGGTCTGATACCCGGCTCCCAGTTTTGGGATGCATCCAAAACTTTGAGAACTCTCCTTGAGGAAGAATATTTTAGGGAAAAGCTAAGTGATGGCATTGGGGTGATGTTACCCCAGGTGCTTAAAGGTATGACTTCAGAGTCTGATTCCATTGGGTTGACACCAGGAGAGAAAAGTGAATTGGCCCTCTCTGCTCTAGGTGGTTGTGTCTTCTACCTCAAAAAATGCCTTATTGATCAGGAGCTTTTATCAATGGCTAATTTTGAAGAATATATTCCCTTGGATTCTGACACAGTCAGCACTACAAGATCTGGTGCTATCTTCACCAAAGCCTATCAACGAATGGTGCTAGATGCAGTGACATTAAACAACTTGGAGATTTTTCTGAATGGAACAAATGGTTCTACTGAAGGAACCCTACTAGAGAGGGTTGATACTTGCCATACTCCTTTTGGTAAGCGGCTCCTAAAGCAATGGCTTTGTGCCCCACTCTGTAACCATTATGCTATTAATGATCGTCTAGATGCCATAGAAGACCTCATGGTTGTGCCTGACAAAATCTCCGAAGTTGTAGAGCTTCTAAAGAAGCTTCCAGATCTTGAGAGGCTACTCAGTAAAATTCATAATGTTGGGTCTCCCCTGAAGAGTCAGAACCACCCAGACAGCAGGGCTATAATGTATGAAGAAACTACATACAGCAAGAAGAAGATTATTGATTTTCTTTCTGCTCTGGAAGGATTCAAAGTAATGTGTAAAATTATAGGGATCATGGAAGAAGTTGCTGATGGTTTTAAGTCTAAANN
benign
35,532
A mutation at chromosome position 47798618 on chromosome 2 in gene MSH6 (mutS homolog 6): benign or pathogenic? If pathogenic, which disease(s) is it linked to?
pathogenic; ['Hereditary_cancer-predisposing_syndrome']
TTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTGCTTTCCCTGGGCAGAGAATCCTTGCCCTTCTTGTATTATGTCACTTTGTGGGGTTGGTGTCTGCTACACTTACAGCAAGTCCAGAGATTTTTTTTCCACCACGTTTGCAGGAGAACTATTGGCATGGAAAATGACAATTGTTTTAATGTCAAGTGAAACTGAAGTTGATGTTCATTGAGAGGTTTCTAATTTCTAGAGGTGGGTTCTTTTTTTGGCATATGAAGTTGCAGCATATTAAGAGAATTTACAGTAGTACAGATGGGGTTATCCCATCCACAACTTATGATGGGGTTACATAAACTAAAAACGTGTTTAATACACCTACCCCACCGAATATTGTAGCTTGGGCGTAGCCTAACCTATCTCAGACGTGCTCAGAACACTTAAATGTTAGCCTAAAGTTGGGCAAGATCATCTAACACAAAGCCTATTTTATAATAAGGAATTGCCTATCTCATGTAATTCATCGAATACTGTACTAAAAATGAAAAACAGTGGCTGCACGGGTACCATTATAAAGTCAAAAAATCATAAGTTGAACTGTCTTACATTATGGTTTTCCAAATTTTGATTTGTTTTTAAATACTCTTTCCTTGCCTGGCAGGTAGGCACAACTTACGTAACAGATAAGAGTGAAGAAGATAATGAAATTGAGAGTGAAGAGGAAGTACAGCCTAAGACACAAGGATCTAGGCGAAGTAGCCGCCAAATAAAAAAACGAAGGGTCATATCAGATTCTGAGAGTGACATTGGTGGCTCTGATGTGGAATTTAAGCCAGACACTAAGGAGGAAGGAAGCAGTGATGAAATAAGCAGTGGAGTGGGGGATAGTGAGAGTGAAGGCCTGAACAGCCCTGTCAAAGTTGCTCGAAAGCGGAAGAGAATGGTGACTGGAAATGGCTCTCTTAAAAGGAAAAGCTCTAGGAAGGAAACGCCCTCAGCCACCAAACAAGCAACTAGCATTTCATCAGAAACCAAGAATACTTTGAGAGCTTTCTCTGCCCCTCAAAATTCTGAATCCCAAGCCCACGTTAGTGGAGGTGGTGATGACAGTAGTCGCCCTACTGTTTGGTATCATGAAACTTTAGAATGGCTTAAGGAGGAAAAGAGAAGAGATGAGCACAGGAGGAGGCCTGATCACCCCGATTTTGATGCATCTACACTCTATGTGCCTGAGGATTTCCTCAATTCTTGTACTCCTGGGATGAGGAAGTGGTGGCAGATTAAGTCTCAGAACTTTGATCTTGTCATCTGTTACAAGGTGGGGAAATTTTATGAGCTGTACCACATGGATGCTCTTATTGGAGTCAGTGAACTGGGGCTGGTATTCATGAAAGGCAACTGGGCCCATTCTGGCTTTCCTGAAATTGCATTTGGCCGTTATTCAGATTCCCTGGTGCAGAAGGGCTATAAAGTAGCACGAGTGGAACAGACTGAGACTCCAGAAATGATGGAGGCACGATGTAGAAAGATGGCACATATATCCAAGTATGATAGAGTGGTGAGGAGGGAGATCTGTAGGATCATTACCAAGGGTACACAGACTTACAGTGTGCTGGAAGGTGATCCCTCTGAGAACTACAGTAAGTATCTTCTTAGCCTCAAAGAAAAAGAGGAAGATTCTTCTGGCCATACTCGTGCATATGGTGTGTGCTTTGTTGATACTTCACTGGGAAAGTTTTTCATAGGTCAGTTTTCAGATGATCGCCATTGTTCGAGATTTAGGACTCTAGTGGCACACTATCCCCCAGTACAAGTTTTATTTGAAAAAGGAAATCTCTCAAAGGAAACTAAAACAATTCTAAAGAGTTCATTGTCCTGTTCTCTTCAGGAAGGTCTGATACCCGGCTCCCAGTTTTGGGATGCATCCAAAACTTTGAGAACTCTCCTTGAGGAAGAATATTTTAGGGAAAAGCTAAGTGATGGCATTGGGGTGATGTTACCCCAGGTGCTTAAAGGTATGACTTCAGAGTCTGATTCCATTGGGTTGACACCAGGAGAGAAAAGTGAATTGGCCCTCTCTGCTCTAGGTGGTTGTGTCTTCTACCTCAAAAAATGCCTTATTGATCAGGAGCTTTTATCAATGGCTAATTTTGAAGAATATATTCCCTTGGATTCTGACACAGTCAGCACTACAAGATCTGGTGCTATCTTCACCAAAGCCTATCAACGAATGGTGCTAGATGCAGTGACATTAAACAACTTGGAGATTTTTCTGAATGGAACAAATGGTTCTACTGAAGGAACCCTACTAGAGAGGGTTGATACTTGCCATACTCCTTTTGGTAAGCGGCTCCTAAAGCAATGGCTTTGTGCCCCACTCTGTAACCATTATGCTATTAATGATCGTCTAGATGCCATAGAAGACCTCATGGTTGTGCCTGACAAAATCTCCGAAGTTGTAGAGCTTCTAAAGAAGCTTCCAGATCTTGAGAGGCTACTCAGTAAAATTCATAATGTTGGGTCTCCCCTGAAGAGTCAGAACCACCCAGACAGCAGGGCTATAATGTATGAAGAAACTACATACAGCAAGAAGAAGATTATTGATTTTCTTTCTGCTCTGGAAGGATTCAAAGTAATGTGTAAAATTATAGGGATCATGGAAGAAGTTGCTGATGGTTTTAAGTCTAAAATCCTTAAGCAGGTCATCTCTCTGCAG
TTTTTTGTTGTATTTTGCATTCATAAGAATAGATGTTAAATAAACCTTGAAATACAACCTTGGCTCAAACGTTAATGGTCATGGATAAAGTGAATTAAAACTTGTTAGGGGCCAGGTGTGGTGGTTAATGCCTATAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGCAGTTGGATGTCCTGAGGACAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTTTCTATAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACCACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACTTGGGAGGCAGAGGGACTTGGGAGGCAGAGGGTGTAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCATTCCAGCCAGGGTGACAGAGCAAGAAGACTGTCAACAACAACAAAAAATGTTATAGAAGTGAAAAAAATTGATTAATTTAGAACAAGCTTGTCCAGTCTGTGGCCCAGGATGGCGTTTAAATCAGCCCAACACAAATTTGTAAACTTTCTTAAAACATTTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTTAGCTCATCAGCTATCATTAGCATTAGTGTATTTTATGTGTGGCCTAAGACAATTCTTCCAGTGTGGCCCAGGGAAGCTGAAAGATCATTATCCTCTGATCTATCATATTAATGAGCTGCATCCTAAAAGACATTCATCTATAACTAAGCTCAGTTTCATGTTTTGTTCCTTTTTCAATAGATAAGATAGGGAATGAGCAAGTTAATAAAGTGGGTATTTTAATTTTAAGGTTGAAACTAAGGATCATAACATTATCAGAGGTCTAGAACTGGATGGCAGCTACAGAGATCATTTAGCCTAATACTGGTTTAACAAATAATCCGGGAGATCCGTGATATGTGAATGTGCTAGGCCTGAGATGAGACAGCCAATTGTGGAAGAGCAAACACTAGAACCAGTATAAGTTGCTTACTGCTTTCTTATGCTATTAATGAGCATATCGCCTCCTGATATTTATGATATATGGTCATGCCAACAGCTTTGTCATAAATAGAACTCCCATGGCAGCAATCACTTAATCTTGTAGTTAGAGGTGGGGTCTCACCATGTTGCCGAGCTGGCCTTGAACTTCTGGGCTCAGCGATTTTCTCCACAGGCACCTGCTACTGTGCTCGGTGCAGCACTTTGTGTTTTTGAACATAACCTCAAGATGTTATTGTCTTCATAGTAAAACAAAAGATGAGGCTTAGAACTGGATCACTTTGCCTGTCTCTTCTTACCTCCTCCCAGTTCAAAATGCTTGCATCTCTTAATAGCTAGCATTCCCTTGGATTTTGCACATGAGCTCAAACTCAAGCCTCAGCACAATCTTTTTTATAGTTTTAGTCTTTTAGCCAGAGTCGACTTACCCCCCATACCCACTCTGCTTCCTTCATAATGCTGCTTTCCCTGGGCAGAGAATCCTTGCCCTTCTTGTATTATGTCACTTTGTGGGGTTGGTGTCTGCTACACTTACAGCAAGTCCAGAGATTTTTTTTCCACCACGTTTGCAGGAGAACTATTGGCATGGAAAATGACAATTGTTTTAATGTCAAGTGAAACTGAAGTTGATGTTCATTGAGAGGTTTCTAATTTCTAGAGGTGGGTTCTTTTTTTGGCATATGAAGTTGCAGCATATTAAGAGAATTTACAGTAGTACAGATGGGGTTATCCCATCCACAACTTATGATGGGGTTACATAAACTAAAAACGTGTTTAATACACCTACCCCACCGAATATTGTAGCTTGGGCGTAGCCTAACCTATCTCAGACGTGCTCAGAACACTTAAATGTTAGCCTAAAGTTGGGCAAGATCATCTAACACAAAGCCTATTTTATAATAAGGAATTGCCTATCTCATGTAATTCATCGAATACTGTACTAAAAATGAAAAACAGTGGCTGCACGGGTACCATTATAAAGTCAAAAAATCATAAGTTGAACTGTCTTACATTATGGTTTTCCAAATTTTGATTTGTTTTTAAATACTCTTTCCTTGCCTGGCAGGTAGGCACACTTACGTAACAGATAAGAGTGAAGAAGATAATGAAATTGAGAGTGAAGAGGAAGTACAGCCTAAGACACAAGGATCTAGGCGAAGTAGCCGCCAAATAAAAAAACGAAGGGTCATATCAGATTCTGAGAGTGACATTGGTGGCTCTGATGTGGAATTTAAGCCAGACACTAAGGAGGAAGGAAGCAGTGATGAAATAAGCAGTGGAGTGGGGGATAGTGAGAGTGAAGGCCTGAACAGCCCTGTCAAAGTTGCTCGAAAGCGGAAGAGAATGGTGACTGGAAATGGCTCTCTTAAAAGGAAAAGCTCTAGGAAGGAAACGCCCTCAGCCACCAAACAAGCAACTAGCATTTCATCAGAAACCAAGAATACTTTGAGAGCTTTCTCTGCCCCTCAAAATTCTGAATCCCAAGCCCACGTTAGTGGAGGTGGTGATGACAGTAGTCGCCCTACTGTTTGGTATCATGAAACTTTAGAATGGCTTAAGGAGGAAAAGAGAAGAGATGAGCACAGGAGGAGGCCTGATCACCCCGATTTTGATGCATCTACACTCTATGTGCCTGAGGATTTCCTCAATTCTTGTACTCCTGGGATGAGGAAGTGGTGGCAGATTAAGTCTCAGAACTTTGATCTTGTCATCTGTTACAAGGTGGGGAAATTTTATGAGCTGTACCACATGGATGCTCTTATTGGAGTCAGTGAACTGGGGCTGGTATTCATGAAAGGCAACTGGGCCCATTCTGGCTTTCCTGAAATTGCATTTGGCCGTTATTCAGATTCCCTGGTGCAGAAGGGCTATAAAGTAGCACGAGTGGAACAGACTGAGACTCCAGAAATGATGGAGGCACGATGTAGAAAGATGGCACATATATCCAAGTATGATAGAGTGGTGAGGAGGGAGATCTGTAGGATCATTACCAAGGGTACACAGACTTACAGTGTGCTGGAAGGTGATCCCTCTGAGAACTACAGTAAGTATCTTCTTAGCCTCAAAGAAAAAGAGGAAGATTCTTCTGGCCATACTCGTGCATATGGTGTGTGCTTTGTTGATACTTCACTGGGAAAGTTTTTCATAGGTCAGTTTTCAGATGATCGCCATTGTTCGAGATTTAGGACTCTAGTGGCACACTATCCCCCAGTACAAGTTTTATTTGAAAAAGGAAATCTCTCAAAGGAAACTAAAACAATTCTAAAGAGTTCATTGTCCTGTTCTCTTCAGGAAGGTCTGATACCCGGCTCCCAGTTTTGGGATGCATCCAAAACTTTGAGAACTCTCCTTGAGGAAGAATATTTTAGGGAAAAGCTAAGTGATGGCATTGGGGTGATGTTACCCCAGGTGCTTAAAGGTATGACTTCAGAGTCTGATTCCATTGGGTTGACACCAGGAGAGAAAAGTGAATTGGCCCTCTCTGCTCTAGGTGGTTGTGTCTTCTACCTCAAAAAATGCCTTATTGATCAGGAGCTTTTATCAATGGCTAATTTTGAAGAATATATTCCCTTGGATTCTGACACAGTCAGCACTACAAGATCTGGTGCTATCTTCACCAAAGCCTATCAACGAATGGTGCTAGATGCAGTGACATTAAACAACTTGGAGATTTTTCTGAATGGAACAAATGGTTCTACTGAAGGAACCCTACTAGAGAGGGTTGATACTTGCCATACTCCTTTTGGTAAGCGGCTCCTAAAGCAATGGCTTTGTGCCCCACTCTGTAACCATTATGCTATTAATGATCGTCTAGATGCCATAGAAGACCTCATGGTTGTGCCTGACAAAATCTCCGAAGTTGTAGAGCTTCTAAAGAAGCTTCCAGATCTTGAGAGGCTACTCAGTAAAATTCATAATGTTGGGTCTCCCCTGAAGAGTCAGAACCACCCAGACAGCAGGGCTATAATGTATGAAGAAACTACATACAGCAAGAAGAAGATTATTGATTTTCTTTCTGCTCTGGAAGGATTCAAAGTAATGTGTAAAATTATAGGGATCATGGAAGAAGTTGCTGATGGTTTTAAGTCTAAAATCCTTAAGCAGGTCATCTCTCTGCAGN
pathogenic
35,550