id
stringlengths 11
16
| input_receptor
stringlengths 105
110
| input_ligand
stringlengths 1
1.12k
| input_template
stringlengths 105
110
|
---|---|---|---|
2zcz_2_TRP_3 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/2zcz_2_TRP_3_holo_aligned_predicted_protein.pdb | N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(=O)O|N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(=O)O|N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(=O)O | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/2zcz_2_TRP_3_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
5ida_1_BMA_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/5ida_1_BMA_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | CC(O)N[C@@H](C)CO|CC(O)N[C@@H](C)CO|OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/5ida_1_BMA_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
5k66_1_ASN-GLU_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/5k66_1_ASN-GLU_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | NC(O)C[C@H](N)CO|N[C@H](CO)CCC(O)O | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/5k66_1_ASN-GLU_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
1rqp_1_SAM_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/1rqp_1_SAM_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | C[S@@+](CC[C@H](N)C(=O)[O-])C[C@H]1O[C@@H](n2cnc3c(N)ncnc32)[C@H](O)[C@@H]1O|C[S@@+](CC[C@H](N)C(=O)[O-])C[C@H]1O[C@@H](n2cnc3c(N)ncnc32)[C@H](O)[C@@H]1O|C[S@@+](CC[C@H](N)C(=O)[O-])C[C@H]1O[C@@H](n2cnc3c(N)ncnc32)[C@H](O)[C@@H]1O | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/1rqp_1_SAM_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
2q6k_1_ADN_1 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/2q6k_1_ADN_1_holo_aligned_predicted_protein.pdb | Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O|OCCOCCO|OCCOCCO | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/2q6k_1_ADN_1_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
6yao_1_OJ2_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/6yao_1_OJ2_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | CS(C)=O|CS(C)=O|Cc1cc2nc3c(=O)[nH]c(=O)nc-3n(C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@H]3O[C@@H](n4cnc5c(N)ncnc54)[C@H](O)[C@@H]3O)c2cc1C|O=C(Nc1cccc(OC(F)(F)F)c1)Nc1ccccc1CCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/6yao_1_OJ2_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
5fiu_1_Y3J_3 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/5fiu_1_Y3J_3_holo_aligned_predicted_protein.pdb | Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](C(F)F)[C@@H](O)C1O|Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](C(F)F)[C@@H](O)[C@@H]1O|Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](C(F)F)[C@@H](O)[C@H]1O|O=C(O)[C@H](O)[C@@H](O)C(=O)O|O=C(O)[C@H](O)[C@@H](O)C(=O)O|O=C(O)[C@H](O)[C@@H](O)C(=O)O | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/5fiu_1_Y3J_3_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
6qkr_1_FAD_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/6qkr_1_FAD_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | CC(C)(COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@H]1O[C@@H](n2cnc3c(N)ncnc32)[C@H](O)[C@@H]1OP(=O)(O)O)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)c1ccc2ccccc2c1|Cc1cc2nc3c(=O)[nH]c(=O)nc-3n(C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)COP(=O)(O)O)c2cc1C|Cc1cc2nc3c(=O)[nH]c(=O)nc-3n(C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@H]3O[C@@H](n4cnc5c(N)ncnc54)[C@H](O)[C@@H]3O)c2cc1C|[SH]12[Fe]3456[SH]7[Fe]1389[SH]1[Fe]2483[SH]5[Fe]71693 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/6qkr_1_FAD_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
1uf5_1_CDT_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/1uf5_1_CDT_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | CSCC[C@@H](NC(N)=O)C(=O)O|CSCC[C@@H](NC(N)=O)C(=O)O|OCCO | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/1uf5_1_CDT_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
3jqm_1_GTP_5 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/3jqm_1_GTP_5_holo_aligned_predicted_protein.pdb | Nc1nc2c(ncn2[C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)[nH]1|Nc1nc2c(ncn2[C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)[nH]1|Nc1nc2c(ncn2[C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)[nH]1|O=C([O-])CC(O)(CC(=O)[O-])C(=O)[O-]|O=C([O-])CC(O)(CC(=O)[O-])C(=O)[O-]|O=C([O-])CC(O)(CC(=O)[O-])C(=O)[O-]|OCC(O)CO|OCC(O)CO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCOCCO|OCCOCCO|OCCOCCO|OCCOCCO | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/3jqm_1_GTP_5_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
5dnc_1_ASN_2 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/5dnc_1_ASN_2_holo_aligned_predicted_protein.pdb | OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/5dnc_1_ASN_2_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
4h2f_1_ADN_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/4h2f_1_ADN_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O|[Ca+2]|[Cl-]|[Zn+2] | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/4h2f_1_ADN_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
5f52_1_ASP_2 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/5f52_1_ASP_2_holo_aligned_predicted_protein.pdb | OCCOCCO|OCCOCCO|OCCOCCO|OCCOCCO|OCCOCCO | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/5f52_1_ASP_2_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
4mig_1_G3F_2 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/4mig_1_G3F_2_holo_aligned_predicted_protein.pdb | Cc1cc2c(cc1C)N(C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@H]1O[C@@H](n3cnc4c(N)ncnc43)[C@H](O)[C@@H]1O)c1[nH]c(=O)[nH]c(=O)c1N2|Cc1cc2c(cc1C)N(C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@H]1O[C@@H](n3cnc4c(N)ncnc43)[C@H](O)[C@@H]1O)c1[nH]c(=O)[nH]c(=O)c1N2|Cc1cc2c(cc1C)N(C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@H]1O[C@@H](n3cnc4c(N)ncnc43)[C@H](O)[C@@H]1O)c1[nH]c(=O)[nH]c(=O)c1N2|Cc1cc2c(cc1C)N(C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@H]1O[C@@H](n3cnc4c(N)ncnc43)[C@H](O)[C@@H]1O)c1[nH]c(=O)[nH]c(=O)c1N2|OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](F)[C@@H]1O|OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](F)[C@@H]1O|OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](F)[C@@H]1O|OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](F)[C@@H]1O|[Mn]|[Mn]|[Mn]|[Mn]|[Mn]|[Mn]|[Mn]|[Mn] | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/4mig_1_G3F_2_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
1tke_1_SER_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/1tke_1_SER_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | N[C@@H](CO)C(=O)O | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/1tke_1_SER_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
6ryz_1_SAM_2 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/6ryz_1_SAM_2_holo_aligned_predicted_protein.pdb | C[S@@+](CC[C@H](N)C(=O)[O-])C[C@H]1O[C@@H](n2cnc3c(N)ncnc32)[C@H](O)[C@@H]1O|C[S@@+](CC[C@H](N)C(=O)[O-])C[C@H]1O[C@@H](n2cnc3c(N)ncnc32)[C@H](O)[C@@H]1O|C[S@@+](CC[C@H](N)C(=O)[O-])C[C@H]1O[C@@H](n2cnc3c(N)ncnc32)[C@H](O)[C@@H]1O|OCCO|OCCO|[Cl-]|[Cl-]|[Cl-] | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/6ryz_1_SAM_2_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
4o95_1_245_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/4o95_1_245_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | CS(C)=O|Cc1cc2nc3c(=O)[nH]c(=O)nc-3n(C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@H]3O[C@@H](n4cnc5c(N)ncnc54)[C@H](O)[C@@H]3O)c2cc1C|O=C(Nc1ccccc1)Nc1ccnc(Cl)c1|OCC(O)CO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCO|OCCOCCO|OCCOCCO | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/4o95_1_245_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
2gah_1_NAD_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/2gah_1_NAD_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | Cc1cc2nc3c(=O)[nH]c(=O)nc-3n(C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)COP(=O)(O)O)c2cc1C|Cc1cc2nc3c(=O)[nH]c(=O)nc-3n(C[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@H]3O[C@@H](n4cnc5c(N)ncnc54)[C@H](O)[C@@H]3O)c2cc1C|NC(=O)c1ccc[n+]([C@@H]2O[C@H](COP(=O)([O-])OP(=O)(O)OC[C@H]3O[C@@H](n4cnc5c(N)ncnc54)[C@H](O)[C@@H]3O)[C@@H](O)[C@H]2O)c1|O=C(O)c1ccco1|[Zn+2] | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/2gah_1_NAD_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
6o6y_1_ACK_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/6o6y_1_ACK_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](OP(=O)(O)OC[C@@H]2O[C@H](n3cnc4c(N)ncnc43)[C@H]3OP(=O)(O)O[C@H]32)[C@H]1O|Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](OP(=O)(O)OC[C@@H]2O[C@H](n3cnc4c(N)ncnc43)[C@H]3OP(=O)(O)O[C@H]32)[C@H]1O|Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H]2OP(=O)(O)O[C@H]21|Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H]2OP(=O)(O)O[C@H]21 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/6o6y_1_ACK_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
4ydx_1_TCE_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/4ydx_1_TCE_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | O=C(O)CCP(CCC(=O)O)CCC(=O)O|O=S(=O)([O-])[O-]|[Pt+2] | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/4ydx_1_TCE_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
4qa8_1_PJZ_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/4qa8_1_PJZ_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | CCC=CC=CC=CC=CC=CCCC(=O)OC[C@@H](C)OC(=O)CCCCCCCCCCC | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/4qa8_1_PJZ_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
2hk9_1_SKM_0 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/2hk9_1_SKM_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb | Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]1OP(=O)(O)O|O=C(O)C1=C[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C1 | data/dockgen_set/dockgen_holo_aligned_predicted_structures/2hk9_1_SKM_0_holo_aligned_predicted_protein.pdb |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.