Spaces:
Running
Running
Remove unused imports and dependencies
Browse files- requirements.txt +0 -2
- tumor_detection_app.py +37 -34
requirements.txt
CHANGED
@@ -2,8 +2,6 @@ streamlit
|
|
2 |
Pillow
|
3 |
numpy
|
4 |
pandas
|
5 |
-
h5py
|
6 |
-
matplotlib
|
7 |
opencv-python
|
8 |
scikit-learn
|
9 |
tensorflow
|
|
|
2 |
Pillow
|
3 |
numpy
|
4 |
pandas
|
|
|
|
|
5 |
opencv-python
|
6 |
scikit-learn
|
7 |
tensorflow
|
tumor_detection_app.py
CHANGED
@@ -2,10 +2,7 @@ import streamlit as st
|
|
2 |
from PIL import Image
|
3 |
import numpy as np
|
4 |
import pandas as pd
|
5 |
-
import base64
|
6 |
import os
|
7 |
-
import h5py
|
8 |
-
import matplotlib.pyplot as plt
|
9 |
|
10 |
# Streamlit ile HTML ve CSS ekleme
|
11 |
st.markdown(f"""
|
@@ -20,9 +17,6 @@ st.markdown(f"""
|
|
20 |
background-color: rgba(255, 255, 255, 0.8); /* Beyaz renk, %80 şeffaflık */
|
21 |
padding: 20px;
|
22 |
border-radius: 10px;
|
23 |
-
background-image: url("/Users/eceguney/Desktop/background.PNG"); /* Arka plan resminin yolu */
|
24 |
-
background-position: center;
|
25 |
-
background-repeat: no-repeat;
|
26 |
background-size: cover;
|
27 |
height: 100vh; /* Sayfa yüksekliği */
|
28 |
}}
|
@@ -46,14 +40,6 @@ st.markdown(f"""
|
|
46 |
.sidebar .sidebar-content {{
|
47 |
background-color: #f4f4f9;
|
48 |
}}
|
49 |
-
.section-title {{
|
50 |
-
color: #4CAF50;
|
51 |
-
font-size: 30px;
|
52 |
-
text-align: center;
|
53 |
-
margin: 20px 0;
|
54 |
-
border-bottom: 2px solid #4CAF50;
|
55 |
-
padding-bottom: 5px;
|
56 |
-
}}
|
57 |
|
58 |
.content-box {{
|
59 |
border: 2px solid #4CAF50;
|
@@ -88,10 +74,41 @@ st.markdown(f"""
|
|
88 |
# Ana başlık
|
89 |
st.title("Tümör Tespit Sistemi")
|
90 |
|
|
|
|
|
|
|
91 |
# Menü çubuğu oluştur, her seçenek için benzersiz key parametresi ekle
|
92 |
# Sidebar menu
|
93 |
menu = st.sidebar.selectbox("Menü", ["Anasayfa", "Hakkımızda", "Tümör Tespiti","Örnek Analizlerimiz", "Hasta Yorumları", "Bize Ulaşın"], key="menu_selectbox")
|
94 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
95 |
# Menüye göre sayfaların içeriğini değiştir
|
96 |
if menu == "Anasayfa":
|
97 |
st.markdown('<div class="header"><h2>Hoş Geldiniz!</h2></div>', unsafe_allow_html=True)
|
@@ -150,18 +167,14 @@ elif menu == "Örnek Analizlerimiz":
|
|
150 |
image = Image.open(file_path)
|
151 |
st.image(image, caption=f"MR Görüntüsü: {img_file}", use_container_width=True)
|
152 |
|
153 |
-
#
|
154 |
image_array = np.array(image)
|
155 |
-
|
156 |
|
157 |
-
#
|
158 |
-
if
|
159 |
-
tumor_status = "Tümör Tespit Edildi"
|
160 |
-
explanation = "Görüntüde yüksek kontrastlı alanlar tespit edildi, bu da tümör olasılığını artırıyor."
|
161 |
tumor_found_count += 1
|
162 |
else:
|
163 |
-
tumor_status = "Tümör Yok"
|
164 |
-
explanation = "Görüntüde belirgin bir kontrast farkı bulunmamaktadır, bu da tümör olmadığına işaret edebilir."
|
165 |
non_tumor_count += 1
|
166 |
|
167 |
# Sonuçları göster
|
@@ -200,19 +213,9 @@ elif menu == "Tümör Tespiti":
|
|
200 |
image = Image.open(uploaded_file)
|
201 |
st.image(image, caption="Yüklenen MR Görüntüsü", use_container_width=True)
|
202 |
|
203 |
-
# Görüntü
|
204 |
image_array = np.array(image)
|
205 |
-
|
206 |
-
# Örnek basit analiz: Görüntünün ortalama parlaklık değerini alalım
|
207 |
-
average_brightness = np.mean(image_array)
|
208 |
-
|
209 |
-
# Tümör var mı yok mu tahmini (basit bir yaklaşım)
|
210 |
-
if average_brightness < 100: # Bu eşik değeri tamamen örnektir, daha gelişmiş bir analiz için değiştirilmelidir.
|
211 |
-
tumor_status = "Tümör Tespit Edildi"
|
212 |
-
explanation = "Görüntüde yüksek kontrastlı alanlar tespit edildi, bu da tümör olasılığını artırıyor."
|
213 |
-
else:
|
214 |
-
tumor_status = "Tümör Yok"
|
215 |
-
explanation = "Görüntüde belirgin bir kontrast farkı bulunmamaktadır, bu da tümör olmadığına işaret edebilir."
|
216 |
|
217 |
# Sonuçları göster
|
218 |
st.markdown(f"**Sonuç: {tumor_status}**")
|
|
|
2 |
from PIL import Image
|
3 |
import numpy as np
|
4 |
import pandas as pd
|
|
|
5 |
import os
|
|
|
|
|
6 |
|
7 |
# Streamlit ile HTML ve CSS ekleme
|
8 |
st.markdown(f"""
|
|
|
17 |
background-color: rgba(255, 255, 255, 0.8); /* Beyaz renk, %80 şeffaflık */
|
18 |
padding: 20px;
|
19 |
border-radius: 10px;
|
|
|
|
|
|
|
20 |
background-size: cover;
|
21 |
height: 100vh; /* Sayfa yüksekliği */
|
22 |
}}
|
|
|
40 |
.sidebar .sidebar-content {{
|
41 |
background-color: #f4f4f9;
|
42 |
}}
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
43 |
|
44 |
.content-box {{
|
45 |
border: 2px solid #4CAF50;
|
|
|
74 |
# Ana başlık
|
75 |
st.title("Tümör Tespit Sistemi")
|
76 |
|
77 |
+
# Tümör tespiti için eşik değeri
|
78 |
+
TUMOR_BRIGHTNESS_THRESHOLD = 100
|
79 |
+
|
80 |
# Menü çubuğu oluştur, her seçenek için benzersiz key parametresi ekle
|
81 |
# Sidebar menu
|
82 |
menu = st.sidebar.selectbox("Menü", ["Anasayfa", "Hakkımızda", "Tümör Tespiti","Örnek Analizlerimiz", "Hasta Yorumları", "Bize Ulaşın"], key="menu_selectbox")
|
83 |
|
84 |
+
# Tümör tespiti fonksiyonu
|
85 |
+
def detect_tumor(image_array):
|
86 |
+
"""
|
87 |
+
Görüntü dizisini analiz ederek tümör tespiti yapar
|
88 |
+
|
89 |
+
Args:
|
90 |
+
image_array: Numpy array olarak görüntü
|
91 |
+
|
92 |
+
Returns:
|
93 |
+
tumor_status: Tümör durumu (string)
|
94 |
+
explanation: Açıklama metni (string)
|
95 |
+
has_tumor: Tümör var mı? (boolean)
|
96 |
+
"""
|
97 |
+
# Görüntünün ortalama parlaklık değerini hesapla
|
98 |
+
average_brightness = np.mean(image_array)
|
99 |
+
|
100 |
+
# Tümör var mı yok mu tahmini (basit bir yaklaşım)
|
101 |
+
if average_brightness < TUMOR_BRIGHTNESS_THRESHOLD: # Düşük parlaklık tümör olasılığını artırır
|
102 |
+
tumor_status = "Tümör Tespit Edildi"
|
103 |
+
explanation = "Görüntüde yüksek kontrastlı alanlar tespit edildi, bu da tümör olasılığını artırıyor."
|
104 |
+
has_tumor = True
|
105 |
+
else:
|
106 |
+
tumor_status = "Tümör Yok"
|
107 |
+
explanation = "Görüntüde belirgin bir kontrast farkı bulunmamaktadır, bu da tümör olmadığına işaret edebilir."
|
108 |
+
has_tumor = False
|
109 |
+
|
110 |
+
return tumor_status, explanation, has_tumor
|
111 |
+
|
112 |
# Menüye göre sayfaların içeriğini değiştir
|
113 |
if menu == "Anasayfa":
|
114 |
st.markdown('<div class="header"><h2>Hoş Geldiniz!</h2></div>', unsafe_allow_html=True)
|
|
|
167 |
image = Image.open(file_path)
|
168 |
st.image(image, caption=f"MR Görüntüsü: {img_file}", use_container_width=True)
|
169 |
|
170 |
+
# Görüntü analizi
|
171 |
image_array = np.array(image)
|
172 |
+
tumor_status, explanation, has_tumor = detect_tumor(image_array)
|
173 |
|
174 |
+
# Sayaçları güncelle
|
175 |
+
if has_tumor:
|
|
|
|
|
176 |
tumor_found_count += 1
|
177 |
else:
|
|
|
|
|
178 |
non_tumor_count += 1
|
179 |
|
180 |
# Sonuçları göster
|
|
|
213 |
image = Image.open(uploaded_file)
|
214 |
st.image(image, caption="Yüklenen MR Görüntüsü", use_container_width=True)
|
215 |
|
216 |
+
# Görüntü analizi
|
217 |
image_array = np.array(image)
|
218 |
+
tumor_status, explanation, _ = detect_tumor(image_array)
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
219 |
|
220 |
# Sonuçları göster
|
221 |
st.markdown(f"**Sonuç: {tumor_status}**")
|