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9a33833 8ae36cb 9a33833 9be1c64 a6e838a 1ce93ee 9be1c64 521ae0b a6e838a 521ae0b 7e8e126 9d8a1d3 8572e8e 9d8a1d3 a6e838a 9d8a1d3 8572e8e 9d8a1d3 a6e838a 9d8a1d3 64bcbd0 b511adc 9d8a1d3 80ced1a 9d8a1d3 8572e8e 9d8a1d3 8572e8e 9d8a1d3 e90cabe 9d8a1d3 31efb8e 9d8a1d3 31efb8e e90cabe 9d8a1d3 e90cabe 9d8a1d3 192d5d7 e90cabe 31efb8e e90cabe |
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import os
os.system('pip install curl_cffi tqdm bitsandbytes tiktoken g4f pinecone-client pandas datasets sentence-transformers')
# Setup and load your keys
import os
from g4f import ChatCompletion
#from google.colab import userdata
from pinecone import Pinecone
import pandas as pd
from datasets import Dataset
from sentence_transformers import SentenceTransformer
import gradio as gr
model_name = "BAAI/bge-m3"
# Retrieve the Pinecone API key from the user
PINECONE_API_KEY = "3a3e9022-381d-436e-84cb-ba93464d283e" # Use the key you set in the secrets
PINECONE_ENVIRONMENT = "us-east-1" # Use the environment you set in the secrets
# Initialize Pinecone with the API key
pc = Pinecone(api_key=PINECONE_API_KEY)
# Global variables to store the selected model and dimensions
EMBED_MODEL = 'BGE_M3-1024'
DIMENSIONS = 1024
# Confirm selection automatically
print(f"Model selected: {EMBED_MODEL}")
print(f"Dimensions set as: {DIMENSIONS}")
# Function to print current selection (can be used in other cells)
def print_current_selection():
print(f"Currently selected model: {EMBED_MODEL}")
print(f"Dimensions: {DIMENSIONS}")
# Establecer el nombre del índice automáticamente
INDEX_NAME = 'neonatos'
# Obtener la clave API de Pinecone
#PINECONE_API_KEY = userdata.get('PINECONE_API_KEY')
def connect_to_pinecone(index_name):
global INDEX_NAME
try:
pc = Pinecone(api_key=PINECONE_API_KEY)
index = pc.Index(index_name)
# Asegurarse de que la conexión se establezca
index_stats = index.describe_index_stats()
print(f"Successfully connected to Pinecone index '{index_name}'!")
print("Index Stats:", index_stats)
# Actualizar la variable global INDEX_NAME
INDEX_NAME = index_name
print(f"Global INDEX_NAME updated to: {INDEX_NAME}")
except Exception as e:
print(f"Failed to connect to Pinecone index '{index_name}':", str(e))
# Conectar automáticamente al índice "neonatos"
connect_to_pinecone(INDEX_NAME)
# Función para imprimir el nombre del índice actual (puede ser usada en otras celdas)
def print_current_index():
print(f"Current index name: {INDEX_NAME}")
# Verificar si las variables globales necesarias están configuradas
if 'INDEX_NAME' not in globals() or INDEX_NAME is None:
raise ValueError("INDEX_NAME is not set. Please set the index name first.")
if 'EMBED_MODEL' not in globals() or EMBED_MODEL is None:
raise ValueError("EMBED_MODEL is not set. Please select an embedding model first.")
# Inicializar cliente de Pinecone
#PINECONE_API_KEY = userdata.get('PINECONE_API_KEY')
pc = Pinecone(api_key=PINECONE_API_KEY)
# Inicializar el índice de Pinecone
index = pc.Index(INDEX_NAME)
# Obtener la dimensión del índice
index_stats = index.describe_index_stats()
vector_dim = index_stats['dimension']
print(f"Index dimension: {vector_dim}")
# Definir manualmente los campos de contexto y enlace
CONTEXT_FIELDS = ['Tag','Pregunta','Respuesta']
LINK_FIELDS = ['Tag','Respuesta']
# Imprimir confirmación de campos seleccionados
print(f"Context fields set to: {CONTEXT_FIELDS}")
print(f"Link fields set to: {LINK_FIELDS}")
# Función para obtener las selecciones actuales de campos (puede ser usada en otras celdas)
def get_field_selections():
return {
"CONTEXT_FIELDS": CONTEXT_FIELDS,
"LINK_FIELDS": LINK_FIELDS
}
#####################################
# Check if required global variables are set
if 'EMBED_MODEL' not in globals() or EMBED_MODEL is None:
raise ValueError("EMBED_MODEL is not set. Please select an embedding model first.")
if 'INDEX_NAME' not in globals() or INDEX_NAME is None:
raise ValueError("INDEX_NAME is not set. Please create or select an index first.")
if 'CONTEXT_FIELDS' not in globals() or 'LINK_FIELDS' not in globals():
raise ValueError("CONTEXT_FIELDS and LINK_FIELDS are not set. Please run the field selection cell first.")
# Initialize the Sentence-Transformer model
embedding_model = SentenceTransformer(model_name)
# Initialize Pinecone with the API key and connect to the index
pinecone_client = Pinecone(api_key=PINECONE_API_KEY)
index = pinecone_client.Index(INDEX_NAME)
# Constants
LIMIT = 3750
def vector_search(query):
# Generate embedding using Sentence-Transformer model
xq = embedding_model.encode(query)
# Perform vector search on Pinecone index
res = index.query(vector=xq.tolist(), top_k=3, include_metadata=True)
if res['matches']:
return [
{
'content': ' '.join(f"{k}: {v}" for k, v in match['metadata'].items() if k in CONTEXT_FIELDS and k != 'Tag'),
'metadata': match['metadata']
}
for match in res['matches']
if 'metadata' in match
]
return []
def create_prompt(query, contexts):
prompt_start = "\n\nContexto:\n"
prompt_end = f"\n\nPregunta: {query}\nRespuesta:"
current_contexts = "\n\n---\n\n".join([context['content'] for context in contexts])
if len(prompt_start + current_contexts + prompt_end) >= LIMIT:
# Truncate contexts if they exceed the limit
available_space = LIMIT - len(prompt_start) - len(prompt_end)
truncated_contexts = current_contexts[:available_space]
return prompt_start + truncated_contexts + prompt_end
else:
return prompt_start + current_contexts + prompt_end
def complete(prompt):
return [f"Hola"]
def check_image_exists(filepath):
return os.path.exists(filepath)
def chat_function(message, history):
# Perform vector search
search_results = vector_search(message)
# Create prompt with relevant contexts
query_with_contexts = create_prompt(message, search_results)
# Generate response
response = complete(query_with_contexts)
partial_message = response[0].split("\n")[0] # Solo tomar la primera línea de la respuesta
# Handle the logic for processing tags and images internally
relevant_links = [result['metadata'].get(field) for result in search_results for field in LINK_FIELDS if field in result['metadata']]
full_response = partial_message
image_url = None
tags_detected = []
filtered_links = []
if relevant_links:
for link in relevant_links:
if any(tag in link for tag in ["rId101", "rId105", "rId109", "rId113", "rId117",
"rId121", "rId125", "rId129", "rId133", "rId136",
"rId139", "rId142", "rId145", "rId149", "rId153",
"rId157", "rId161", "rId165", "rId169", "rId173",
"rId177", "rId180", "rId184", "rId187", "rId192",
"rId195", "rId40", "rId44", "rId47", "rId50",
"rId53", "rId56", "rId59", "rId63", "rId66",
"rId70", "rId73", "rId76", "rId80", "rId83",
"rId87", "rId90", "rId94", "rId97"]):
tags_detected.append(link) # Save the tag but don't display it
else:
filtered_links.append(link)
# Add the first relevant link under a single "Respuestas relevantes" section
if filtered_links:
full_response += f".\n\nTe detallamos nuestro contenido a continuación:\n" + filtered_links[0]
# Now handle the images based on the detected tags
tags_to_images = {
"rId101": "images/rId101.png",
"rId105": "images/rId105.png",
"rId109": "images/rId109.png",
"rId113": "images/rId113.png",
"rId117": "images/rId117.png",
"rId121": "images/rId121.png",
"rId125": "images/rId125.png",
"rId129": "images/rId129.png",
"rId133": "images/rId133.png",
"rId136": "images/rId136.png",
"rId139": "images/rId139.png",
"rId142": "images/rId142.png",
"rId145": "images/rId145.png",
"rId149": "images/rId149.png",
"rId153": "images/rId153.png",
"rId157": "images/rId157.png",
"rId161": "images/rId161.png",
"rId165": "images/rId165.png",
"rId169": "images/rId169.png",
"rId173": "images/rId173.png",
"rId177": "images/rId177.png",
"rId180": "images/rId180.png",
"rId184": "images/rId184.png",
"rId187": "images/rId187.png",
"rId192": "images/rId192.png",
"rId195": "images/rId195.png",
"rId40": "images/rId40.png",
"rId44": "images/rId44.png",
"rId47": "images/rId47.png",
"rId50": "images/rId50.png",
"rId53": "images/rId53.png",
"rId56": "images/rId56.png",
"rId59": "images/rId59.png",
"rId63": "images/rId63.png",
"rId66": "images/rId66.png",
"rId70": "images/rId70.png",
"rId73": "images/rId73.png",
"rId76": "images/rId76.png",
"rId80": "images/rId80.png",
"rId83": "images/rId83.png",
"rId87": "images/rId87.png",
"rId90": "images/rId90.png",
"rId94": "images/rId94.png",
"rId97": "images/rId97.png",
}
for tag in tags_detected:
for key, path in tags_to_images.items():
if key in tag and check_image_exists(path):
image_url = path
break
return full_response, image_url
def update_image(image_url):
if image_url:
return image_url
else:
return None
# Función para procesar la entrada del chatbot
def process_input(message, history):
# Implementa tu lógica de procesamiento aquí
response = f"Procesando: {message}"
history.append((message, response))
return history, history, None
# Función para enviar una pregunta preestablecida
def send_preset_question(question, history):
return process_input(question, history)
# Lista ampliada de categorías y preguntas
categories = [
("Diagnósticos", [
"¿Cuál es el diagnóstico más común registrado en el dataset?",
"¿Cuáles son los diagnósticos más frecuentes que requieren hospitalización prolongada?",
"¿Qué tan frecuentes son los diagnósticos relacionados con nacimientos prematuros?",
"¿Cuál es la incidencia de diagnósticos graves como el 'Síndrome de Dificultad Respiratoria' (P220)?",
"¿Cuáles son los códigos CIE-10 relacionados con infecciones neonatales?",
"¿Qué diagnósticos están clasificados bajo el código P00-P96 en neonatos?",
"¿Cuáles son los diagnósticos menos comunes en el dataset?",
"¿Cómo se distribuyen los diagnósticos entre pacientes masculinos y femeninos?",
"¿Existen diferencias significativas en los diagnósticos entre diferentes departamentos?"
]),
("Medicamentos", [
"¿Qué medicamentos son más usados en neonatos?",
"¿Cuál es el medicamento más usado para infecciones neonatales?",
"¿Qué tipo de forma farmacéutica es la más utilizada en neonatos?",
"¿Cuáles son los medicamentos más costosos administrados a recién nacidos?",
"¿Qué proporción de medicamentos administrados son antibióticos?",
"¿Qué porcentaje del total de medicamentos administrados corresponde a la Tetraciclina Clorhidrato?",
"¿Qué medicamentos se utilizan con mayor frecuencia en los departamentos con menos recursos?",
"¿Cuáles son los medicamentos menos comunes administrados en el dataset?",
"¿Qué relación existe entre el tipo de medicamento y el diagnóstico principal?"
]),
("Estadísticas y Frecuencia", [
"¿Qué porcentaje del total de registros corresponde al diagnóstico 'Nacido Vivo Único' (Z370)?",
"¿Cuál es la distribución por edad gestacional de los neonatos en el dataset?",
"¿Cuál es la tasa de readmisión hospitalaria en neonatos?",
"¿Cómo varía la mortalidad neonatal entre diferentes departamentos?",
"¿Hay patrones estacionales en la administración de medicamentos?",
"¿Cuál es la duración promedio de la hospitalización para los recién nacidos?",
"¿Qué proporción de recién nacidos es hospitalizada por más de 7 días?",
"¿Cómo varía la duración de la hospitalización entre los diferentes departamentos?",
"¿Qué diagnósticos están asociados con hospitalizaciones de corta duración?"
]),
("Impacto y Calidad de Datos", [
"¿Cómo impacta el uso de antibióticos en la recuperación neonatal?",
"¿Qué mejoras se pueden implementar en la atención neonatal?",
"¿Cuál es la efectividad de las medidas preventivas en la reducción de infecciones neonatales?",
"¿Cuáles son las limitaciones de los datos sobre salud neonatal?",
"¿Qué tan completos y precisos son los registros de diagnóstico?",
"¿Cómo se manejaron los valores faltantes en la variable de peso (PESO)?",
"¿Qué método se utilizó para imputar valores faltantes en la variable de días de hospitalización?",
"¿Cómo se gestionaron los outliers en la variable de peso por género?",
"¿Qué recomendaciones se hicieron para mejorar la calidad de los datos en futuros estudios?"
]),
("Análisis Geográfico", [
"¿Cuál es el departamento con el mayor número de registros de administración de medicamentos?",
"¿Qué departamentos tienen los menores registros de administración de medicamentos?",
"¿Cuál es la diferencia en la administración de medicamentos entre Lima y La Libertad?",
"¿Cómo se distribuyen los registros de administración de medicamentos en áreas urbanas versus rurales?",
"¿Qué departamento muestra la mayor variedad de medicamentos administrados?",
"¿Existen diferencias en el costo de los medicamentos entre diferentes provincias dentro de un mismo departamento?",
"¿Qué provincia tiene el menor registro de administración de medicamentos?",
"¿Cómo varía la administración de medicamentos en los distritos más poblados versus los menos poblados?"
]),
("Análisis Temporal", [
"¿Cuál es el rango de fechas de administración de medicamentos registrado en el dataset?",
"¿En qué meses se registra la mayor cantidad de administración de medicamentos?",
"¿Cuál es la distribución de la administración de medicamentos a lo largo de los días de la semana?",
"¿Existen picos en la administración de medicamentos durante períodos específicos?",
"¿Cómo ha evolucionado la administración de medicamentos desde 2022 hasta 2023?",
"¿Qué impacto tienen las estaciones del año en la administración de medicamentos?",
"¿Cómo varía la administración de medicamentos durante días festivos o feriados?",
"¿Qué variación se observa en la administración de medicamentos al comparar el primer y el último trimestre de 2023?"
])
]
# Configuración de la interfaz de Gradio
with gr.Blocks() as demo:
with gr.Row():
with gr.Column(scale=2):
chatbot_input = gr.Textbox(label="Tu mensaje")
chatbot_output = gr.Chatbot(label="ChatBot")
chatbot_history = gr.State(value=[])
image_url = gr.State(value=None)
submit_button = gr.Button("Enviar")
with gr.Column(scale=1):
image_output = gr.Image(label="Imagen asociada")
# Crear filas de categorías
for i in range(0, len(categories), 3):
with gr.Row():
for category, questions in categories[i:i+3]:
with gr.Column():
with gr.Accordion(category):
for question in questions:
button = gr.Button(question)
button.click(
send_preset_question,
inputs=[gr.State(value=question), chatbot_history],
outputs=[chatbot_output, chatbot_history, image_url]
)
submit_button.click(
process_input,
inputs=[chatbot_input, chatbot_history],
outputs=[chatbot_output, chatbot_history, image_url]
)
# Lanzar la interfaz
demo.launch(debug=True) |